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[求助]
TA克隆連接方向問(wèn)題,實(shí)驗(yàn)室小白,求大神們指教! 已有4人參與
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TA連接方向問(wèn)題。我用pMD19T simple 和帶有BamH1和Hind3的PCR產(chǎn)物鏈接,怎么驗(yàn)證它的連接方向呢? 我接下來(lái)要連接到pET-32a 上表達(dá),已經(jīng)確定用這兩個(gè)酶切位點(diǎn)可以正向連在pET-32a上了,還需要驗(yàn)證PCR產(chǎn)物在克隆載體上的方向嗎? @youlinglyw 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
金蟲(chóng) (正式寫手)
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第一種方法,Sequencing. 第二種是,找一個(gè)離bamh 1 或 離hind3 近的digestion site. 然后用雙酶切 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
金蟲(chóng) (正式寫手)
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用雙酶切的時(shí)候,一般不會(huì)有這種情況。但是常常有很多的意外發(fā)生。比如mutation. 還有就是,你的pcr 產(chǎn)物或許有問(wèn)題的情況也都有。因?yàn)閜cr的時(shí)候,能讀的長(zhǎng)度是有限的。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
版主 (職業(yè)作家)
Yeast Display
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我怎么確定這個(gè)方向呢?酶切位點(diǎn)在設(shè)計(jì)的時(shí)候就要注意其是否在5'還是3'端嗎? 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
送紅花一朵 |
Simple 載體上沒(méi)有酶切位點(diǎn)的~測(cè)序的話也想過(guò),不過(guò)需要花錢,如果實(shí)在是沒(méi)辦法也就只能測(cè)序了~ 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
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還有一點(diǎn)不明白,為什么要驗(yàn)證方向呢?切下來(lái)后不連在表達(dá)載體上一樣嗎?我的理論基礎(chǔ)有些差,還請(qǐng)多指教。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
金蟲(chóng) (正式寫手)
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PCR產(chǎn)物上有酶切位點(diǎn),BamH1和Hind3。但是載體上沒(méi)有其他的酶切位點(diǎn)了,也就是說(shuō)連完后的重組DNA上就只有這兩個(gè)酶切位點(diǎn)。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
金蟲(chóng) (正式寫手)
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不要找載體上的切點(diǎn)。找pcr產(chǎn)物上的切點(diǎn)。除了那兩個(gè)。知道你的pcr產(chǎn)物的sequence嗎?用NEB cutter 可以找到酶切點(diǎn) 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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