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[交流]
質粒重組一直做不出來啊,求大神分析一下原因啊,拜托啦。ㄎ視M可能詳細描述) 已有11人參與
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目前一直在做質粒重組,把目的基因和載體連起來然后進行后續(xù)使用,但是反反復復快2個月了,一直沒有成功啊,很沮喪,請大神幫忙指點迷津啊![]() 1.酶切:我目前想用pcs2載體(4700bp)與想要的幾個基因重組構建,分別是基因A(1700bp),基因B(1300bp),基因C(1000bp)。粘性末端酶切,載體酶切切膠回收,目的基因酶切后過柱純化,過程順利(自認為此步應該不會有問題)。 2.連接:按照說明書計算摩爾體積比混合(總體積10ul,酶和buffer個1ul),這么長時間摸過很多條件:目的基因和載體(100ng)比例做過10比1(做得最多),8比1,3比1,5比1,連接時間大部分選擇4度過夜,甚至4度反應2天3天也有,15度過夜也做過。(NEB和TAKARA兩個公司的都用過,應該不是酶的問題)有時候當沒做出克隆我會將沒用來轉化的液體跑膠看看連上了沒,但是可以跑出來N多條帶,除了能找到載體和目的基因的2條,從10000bp到1000bp會出現(xiàn)5,6個條帶(難道是連接成環(huán)狀質粒所以跑膠條帶很多?那么說連上了?),我是看不懂了。 3.產(chǎn)物轉化圖版:感受態(tài)用的是商品化的dh5a或者top10,步驟一樣(冰30min,42度90s,冰3min),最初我用10ul感受態(tài)+1ul連接產(chǎn)物沒有結果,師兄說多加點,所以我把鏈接產(chǎn)物一直往上加,最多到過9ul,感受態(tài)不變,但是一直沒有結果。轉化完加dd水200ul搖菌復蘇45-60min,我之前其實是用soc搖的,但是實驗室soc出了點問題,所以師兄讓我用水搖,他之前是可以做出來的,我做陽性對照的時候也可以做出菌落(但是菌落數(shù)總不多,不超過200個,而且長得很慢,24h最大的菌落不過1mm左右,感覺效率很低,我陽對加1ul轉化,里面有200多ng的質粒),復蘇后取100ul圖版,37度過夜。結果永遠只有陽性對照有菌落,做過載體自連對照,陰性對照,都沒有,很沮喪。 問題:難道是dna的數(shù)量太少?連接總共就100ng還沒有全做轉化,畢竟200ng的陽對轉的效率也不高;難道是我產(chǎn)物和感受態(tài)配比不對?最近看到連接產(chǎn)物不應超過體系10%,多了感受態(tài)會脹破,難道是因為這個;難道是我用水去復蘇導致效率不高,但是我用陽對是可以的呀,不至于做了這么久一個克隆也不長吧? 現(xiàn)在老板讓我把基因的pcr產(chǎn)物做ta克隆然后在切下來連,說如果酶切位點在dna兩頭酶切得到的粘性末端不好,連接效率低,讓連到質粒上切的好,不知道是不是這個原因???(但是我跑膠出來很多條帶說明我臉上了?) 求大家指點迷津啊啊啊啊,做了這么久都沒結果,哎 ![]() ![]() ![]() ![]() |
至尊木蟲 (著名寫手)

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建議目的基因和載體比例做6:2或5:3,酶連時間四度過夜,或者快連酶22度兩小時。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
木蟲 (正式寫手)

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