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Y/XT新蟲 (小有名氣)
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[求助]
ENCUT收斂性腳本測試問題 已有2人參與
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各位大神好 小弟是vasp小白 請問大家 如何將侯博有關(guān)vaspENCUT收斂性測試的腳本用在自己的run文件中啊 小弟是連在服務(wù)器上計算的 所以需要執(zhí)行任務(wù)的腳本文件 懇請各位大神指導(dǎo) 謝謝 以下是小弟的PBS執(zhí)行文件 和侯博的ENCUT文件 #!/bin/bash #========================================# # PBS Job submission script for VASP #========================================# # 1. PBS job control #PBS -S /bin/bash #PBS -N vasp #PBS -j oe #PBS -q long #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -V #========================================# # 2. Job specification cd ${PBS_O_WORKDIR} inputfile="INCAR" #========================================# export MKL_SERIAL=YES export MKL_NUM_THREADS=1 export OMP_NUM_THREADS=1 export GOTO_NUM_THREADS=1 echo this jobs runs on the following machines: echo `cat $PBS_NODEFILE | uniq ` PROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cat $PBS_NODEFILE | uniq > user.$PBS_JOBID NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` ## for Intel MPI ## /opt/openmpi-1.4.4/bin/mpirun -np $NP -machinefile user.$PBS_JOBID ~/bin/vasp >& out ======================================================================================= #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
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wlandy
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10樓2018-04-13 11:23:13
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4樓2018-04-12 17:58:59
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我沒有懂
11樓2018-04-13 11:55:29
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