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分子對接 已有5人參與
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我的畢業(yè)課題是治療某疾病的天然產(chǎn)物的活性成分計算機虛擬篩選，用到了DS和autodock軟件。我現(xiàn)在用DS初篩之后，再用autodock打開靶點蛋白，處理過后，晶格選擇能包住靶點蛋白活性部位，然后就開始對接了，初篩結(jié)束得到一共七百多個，目前對接了三四百個吧，保留了最低自由結(jié)合能小于-7的配體小分子，再用pymol查看靶點和篩選出來的配體的結(jié)合情況，發(fā)現(xiàn)打開了好多分子與靶點蛋白都沒有氫鍵相連，這樣的話，等到下一步進行ADMET篩選豈不很有可能篩不到東西。這是正�，F(xiàn)象？還是，我的對接位置選擇不對？還是有其他的可能性？大神們你們覺得呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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 autodock |
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10樓2018-04-20 18:10:00
wavingsea9911
木蟲 (小有名氣)
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2樓2018-04-13 22:27:10
3樓2018-04-13 22:40:51
4樓2018-04-13 23:02:02
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