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1937mcq金蟲 (初入文壇)
努力后生
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[求助]
關(guān)于Heatmap的做法 已有1人參與
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如題,目前已經(jīng)有基因的表達數(shù)據(jù),需要做成熱力圖,但是完全不會,,需要請教,望知無不言,做成的圖應(yīng)該是如下圖所示, A@Z6UK3~WZU%]_IFRS%`Y_N.png |

銀蟲 (正式寫手)
至尊木蟲 (著名寫手)
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可以用TMeV來做,把你基因的FPKm表達量的值求log2()對數(shù),然后求所有l(wèi)og2()的平均值和標(biāo)準差,再用每一個log值減去平均值再除以標(biāo)準差,得到Z值,然后用Z值數(shù)據(jù)去tmev作圖就好啦 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |

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現(xiàn)在好多云平臺工具可以做,比如百邁克,基迪奧他們的平臺,數(shù)據(jù)歸一化什么參數(shù)自己選就可以了。注冊一個帳號,小工具免費的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲 (職業(yè)作家)
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