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happydd點(diǎn)點(diǎn)

銅蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 誰(shuí)會(huì)設(shè)計(jì)EST-SSR引物？幫幫俺。已有1人參與

既然SSR引物那么難設(shè)計(jì)，暫時(shí)不想設(shè)計(jì)了。聽(tīng)說(shuō)EST-SSR引物好設(shè)計(jì)。誰(shuí)能幫俺設(shè)計(jì)。作物菠菜。不知道這樣過(guò)不過(guò)分。。。。。。。

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1樓 2015-01-21 14:05:43

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titus0805

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

12樓: Originally posted by happydd點(diǎn)點(diǎn) at 2015-01-22 09:42:46
額。。。。。好慘。...

你打算設(shè)計(jì)多少？預(yù)計(jì)成本有多少？

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13樓2015-01-22 09:45:20

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

前提是有龐大的est數(shù)據(jù)庫(kù)。
你上ncbi，編幾條類(lèi)似”ATATATATATATATATAT“；”ATAATAATAATAATA"，“CTTCTTCTTCTTCTTCTT”這類(lèi)的序列，在est數(shù)據(jù)庫(kù)里blast，物種選擇為菠菜（拉丁名，自己去查），看看能blast多少出來(lái)。用blast出來(lái)的這些序列，在重復(fù)序列兩端設(shè)計(jì)引物。

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2樓2015-01-21 14:21:40

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

2樓: Originally posted by titus0805 at 2015-01-21 14:21:40
前提是有龐大的est數(shù)據(jù)庫(kù)。
你上ncbi，編幾條類(lèi)似”ATATATATATATATATAT“；”ATAATAATAATAATA"，“CTTCTTCTTCTTCTTCTT”這類(lèi)的序列，在est數(shù)據(jù)庫(kù)里blast，物種選擇為菠菜（拉丁名，自己去查），看看能blast多 ...

如果ncbi里blast出來(lái)的太少，可以考慮去測(cè)一個(gè)轉(zhuǎn)錄組，用測(cè)出來(lái)的數(shù)據(jù)blast

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3樓2015-01-21 14:23:08

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引用回帖:

3樓: Originally posted by titus0805 at 2015-01-21 14:23:08
如果ncbi里blast出來(lái)的太少，可以考慮去測(cè)一個(gè)轉(zhuǎn)錄組，用測(cè)出來(lái)的數(shù)據(jù)blast...

怎么測(cè)轉(zhuǎn)錄組？

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4樓2015-01-21 15:07:52

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