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片段連了半年了,死活連不上,要看再不行就要延期了,求大神幫忙分析一下 已有3人參與
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首先我一共要連接三個(gè)片段,直接連接表達(dá)載體,這三個(gè)片段都屬于同一個(gè)基因家族,就是同源性不高,片段是pcr得到的(提取的研究材料全RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA),采用雙酶切的方法,選取的是sal1和BamH1兩個(gè)酶切位點(diǎn),這兩個(gè)酶切位點(diǎn)在載體上離得很近,序列是(GTCGAC)TCTAGA(GGATTC),只間隔了6bp,不過我通過先用sal1酶切在用BamH1酶切的方法已經(jīng)連接上了兩個(gè)片段,這能說明我的載體酶切肯定是沒問題的吧?而且三個(gè)片段都是同一操作流程,也就是說我設(shè)計(jì)的引物也沒問題吧?片段酶切也沒問題吧?但是,第三個(gè)片段,也是最關(guān)鍵的片段,就是死活連不上去,連上那兩個(gè)片段其實(shí)就用了三個(gè)星期……本來我想著,因?yàn)樵瓉淼妮d體酶切后不好判斷酶切程度,我可以通過酶切已經(jīng)連上目的片段的重組質(zhì)粒,跑膠回收酶切好的載體來做連接,但是,重組質(zhì)粒,一切就碎,就跟pcr的引物二聚體似的,根本沒法回收,重新提了一批原始質(zhì)粒和片段做酶切,用50的體系,酶各加2,酶切4小時(shí),跑膠發(fā)現(xiàn),竟然也被切碎了,然后,減小酶量,各加1,發(fā)現(xiàn)還是碎了,是因?yàn)檫@次用的大體系酶切么?我之前酶切用的25的體系……求各位大神幫忙分析一下,描述比較混亂,我現(xiàn)在特別絕望…… @飛約瘋?cè)嗽?/u> @biostar2009 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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按道理酶切位點(diǎn)單一的話,特異性應(yīng)該很好。你用的那個(gè)公司的酶,換個(gè)牌子試試,或者換個(gè)快切的酶,另外酶切時(shí)間不要太長(zhǎng),酶切完記得終止反應(yīng),防止亂切。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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