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分子對(duì)接 已有5人參與
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我的畢業(yè)課題是治療某疾病的天然產(chǎn)物的活性成分計(jì)算機(jī)虛擬篩選，用到了DS和autodock軟件。我現(xiàn)在用DS初篩之后，再用autodock打開(kāi)靶點(diǎn)蛋白，處理過(guò)后，晶格選擇能包住靶點(diǎn)蛋白活性部位，然后就開(kāi)始對(duì)接了，初篩結(jié)束得到一共七百多個(gè)，目前對(duì)接了三四百個(gè)吧，保留了最低自由結(jié)合能小于-7的配體小分子，再用pymol查看靶點(diǎn)和篩選出來(lái)的配體的結(jié)合情況，發(fā)現(xiàn)打開(kāi)了好多分子與靶點(diǎn)蛋白都沒(méi)有氫鍵相連，這樣的話，等到下一步進(jìn)行ADMET篩選豈不很有可能篩不到東西。這是正�，F(xiàn)象？還是，我的對(duì)接位置選擇不對(duì)？還是有其他的可能性？大神們你們覺(jué)得呢？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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