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孤單芭蕾527新蟲 (初入文壇)
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[求助]
載體構(gòu)建 已有1人參與
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我的一個亞細胞定位的載體,載體原本標(biāo)注的只有一個Bam HI的酶切位點,但是我用單酶切出來兩條帶,我不想重新修改目的基因的酶切位點了,請教大佬們,我用Age I和Bam HI雙酶切,然后給載體去磷酸化,再和我的用Age I和Bam HI酶切目的基因連接,可以么? @youlinglyw @biostar2009 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
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1、載體是別的實驗室拿來的,他們也用過Bam HI,說沒有問題,但我確實單用Bam HI切出了兩條帶。 2、Age I驗證過可以切開 3、我之前試過用Age I和Bam HI雙酶切,但是連接后,長得斑太多了,假陽性太多,所以我可不可以,雙酶切后在去磷酸化,防止兩端都是Bam HI的載體連接 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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1. 不知道你原始載體是哪里來的,比如是跟人家要的還是實驗室以前構(gòu)建留下的,如果酶切結(jié)果與你的預(yù)期不一致,而你的預(yù)期是基于很確定的資料的話,最好(1)跟來源的人或者單位再確認一下載體的問題,看能不能更換更準確的載體;(2)送去測序,保證你的MCS區(qū)域或者你關(guān)心的那些關(guān)鍵區(qū)域的序列起碼是正確的,同時,不知道你的質(zhì)粒是否比如說經(jīng)過長時間保存之類的,你可以轉(zhuǎn)克隆感受態(tài)再挑斑多鑒定幾個,看看能不能得到酶切鑒定正確的克隆,然后再拿來用 2. 你說用Age I和BamH I酶切并且連接,這個本身和上面BamH I單酶切鑒定不正確沒有太直接的關(guān)系,只要你的Age I也能夠切開質(zhì)粒(不知道你用Age I驗證過沒有?),理論上就可以進行雙酶切連接,當(dāng)然,看你現(xiàn)在的情況可能載體上有兩個BamH I的位點,那加入Age I的位點位于這兩個Bam H I之間,雙酶切之后Age I位于小條帶你不要的那個小條帶上,這樣確實也不行,所以一定要用Age I驗證一次 |
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把你的電泳圖發(fā)給他們,當(dāng)然你一定要保證你的酶切沒有問題 他們?nèi)绻龅臎]有問題,就讓他們把沒有問題的給你一份,這種載體骨架要是出問題,你后面的實驗就像埋了定時炸彈一樣 所以也建議對MCS區(qū)域測序,確定你目的片段插入的位點附近序列究竟是什么,是否正確 你連接后長斑假陽性多,這相對上面的問題來說又是另一個問題,可能跟你的連接體系、連接時間都有關(guān)系,從而造成高背景。一般雙酶切不需要去磷酸化,一般對于平末端連接或者單酶切連接才需要防止自連 最重要的還是建議你把載體搞清楚,可能你覺得再要一次不太容易或者不好意思,但還是硬著頭皮要個正確的吧,誰也保不準到底哪段序列出了問題,再次就是優(yōu)化你的連接體系,如果想去磷酸化處理防止自連不是不可以,去磷酸化本身也需要些優(yōu)化,而且增加你的操作步驟 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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不好意思,最后一個問題沒解釋清楚 你要是考慮是BamH I單位點造成自連,載體肯定是可以去磷酸化處理的,一般也是這么做的,但是,你的前段是雙位點,在這種假設(shè)的前提下,你片段即使連上去了,這個序列說實話也真是有問題的,即便你說可能是通過菌體自身的修復(fù)機制將片段的Age I末端和載體的BamH I末端連接了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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