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sophie丁新蟲 (初入文壇)
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[求助]
構(gòu)象搜索 已有1人參與
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各位大神，苦于沒有GMMX軟件，請(qǐng)問一下除了GMMX 可采用MMFF94力場(chǎng)進(jìn)行構(gòu)象搜索外，還有哪款軟件也可進(jìn)行同樣的計(jì)算？（可信度高，影響力較大的，有文獻(xiàn)支撐的） 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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結(jié)構(gòu)簡單的話 如果你自己可以一下子給出所有可能的構(gòu)象的初始結(jié)構(gòu)交給高斯去算，當(dāng)然就不需要構(gòu)象搜索。而如果結(jié)構(gòu)復(fù)雜，高斯又只能優(yōu)化出最接近你給的初始結(jié)構(gòu)的那個(gè)能量低點(diǎn)，這樣就很可能會(huì)漏掉一些構(gòu)象（即使有更低能量的構(gòu)象，高斯可能也會(huì)錯(cuò)過。因?yàn)樗惴ㄉ细咚怪荒芨鶕?jù)初始結(jié)構(gòu)來搜尋勢(shì)能面低點(diǎn)，但不確保找到的低點(diǎn)是能量的全局最低點(diǎn)）。構(gòu)象搜索并不是可以讓優(yōu)化更準(zhǔn)或怎么樣的。只是幫你提供給高斯所有可能的構(gòu)象的初始結(jié)構(gòu)。這樣防止漏掉一些構(gòu)象而已。 |
sophie丁8樓2020-08-05 15:03:15
paramecium86
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2樓2020-07-31 12:15:17
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3樓2020-07-31 13:46:02
qinzhong6138
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4樓2020-08-01 16:12:50
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