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nico910902銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于VASP并行計(jì)算的服務(wù)器配置，想購入刀片或機(jī)架式服務(wù)器 已有2人參與
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大家好，小弟接觸VASP有一段時(shí)間，但是大部分計(jì)算都在4核8線程服務(wù)站上單機(jī)并行。由于最近需要計(jì)算的模型略大所以想配置一臺(tái)服務(wù)器，刀片式或者機(jī)架式100核左右。 請問有哪位大神有相關(guān)方面的研究嗎,現(xiàn)有以下一些問題，希望有大神相助: 1. VASP的并行計(jì)算速度跟哪些因素最相關(guān)？（內(nèi)存，核心數(shù)，核心頻率...） 2. 目前有兩個(gè)方案，a 購入10臺(tái)機(jī)架式服務(wù)器（雙處理器/臺(tái)，4核2.6GHz/處理器，內(nèi)存16G/臺(tái)）組成一個(gè)集群；b 直接購入1臺(tái)刀片式服務(wù)器 （擁有10-16個(gè)刀片，每個(gè)刀片配置與a方案中配置相當(dāng)，只是頻率為2.5GHz）。請問哪種方案更適合VASP并行計(jì)算？其實(shí)歸根結(jié)底就是刀片式服務(wù)器和機(jī)架式服務(wù)器的對比以及vasp并行原理的理解。需要考慮服務(wù)器搭建，系統(tǒng)軟件安裝難度等綜合因素。。因?yàn)檫@些都需要自己搞而小弟又對編程并不是特別在行，不想浪費(fèi)太多時(shí)間在上邊。但是哪位大神有相關(guān)學(xué)習(xí)資料的話非常希望能傳給小弟拜讀。 3. 對于以上兩種方案，12G-16G/臺(tái)的內(nèi)存足夠嗎？小弟主要做一些第一原理分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算用以擬合一些合金的勢函數(shù)。 4. VASP在服務(wù)器上的編譯和在單機(jī)上的編譯方法相同嗎？ 求賜教  |
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9樓2017-07-15 21:46:36
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2樓2017-07-04 05:35:14
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3樓2017-07-04 10:02:12
【答案】應(yīng)助回帖
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漫天飄雪: 金幣+2, 謝謝交流 2017-07-04 12:36:31
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1. VASP的并行計(jì)算速度跟CPU核心數(shù)，CPU主頻相關(guān)，還需要根據(jù)你計(jì)算體系大小配置內(nèi)存大小。 2. 機(jī)架式服務(wù)器與刀片式服務(wù)器本質(zhì)上一樣。建議你找一家對VASP深刻理解的高性能計(jì)算集群廠商，提供匹配的配置方案，以及后繼集群搭建和維護(hù)，特別是VASP在集群上的編譯和使用培訓(xùn)。 3. 根據(jù)你計(jì)算體系大小配置內(nèi)存大小。 4. 大同小異，建議找VASP等編譯、使用的技術(shù)支持。 |
4樓2017-07-04 10:49:57
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