晶體有a類錯(cuò)誤怎么也改不出來(lái),求助!
這是個(gè)雙核Mn的晶體結(jié)構(gòu)
晶體質(zhì)量本身就很差,好不容易看到衍射點(diǎn)
現(xiàn)在這個(gè)cif 一方面是R1值太大(0.079),另一方面有A類錯(cuò)誤,以我們的能力,改不出來(lái)
現(xiàn)在想問(wèn)問(wèn)呀,這樣的晶體會(huì)不會(huì)成為被拒的理由啊,我怎么辦啊
如果能有高手幫忙修改A類錯(cuò)誤,我將另贈(zèng)金幣。
先謝謝了!
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
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--------------------------------------------------------------------------------Alert level A
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 6.02 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.97 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C23
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 238.00 A**3
前三個(gè)錯(cuò)誤如果不是投ACTA之類的不用處理
后面一個(gè)squeeze一下就可以了
剛剛你回復(fù)我說(shuō),需要用到ns文件
可是我仔細(xì)查看了手上的文件,沒(méi)看到ns文件啊
過(guò)來(lái)跟帖學(xué)習(xí) squeeze咋用云飛兄
platon中的一個(gè)命令,點(diǎn)一下產(chǎn)生sqf文件,吧產(chǎn)生的信息拷貝到cif中即可
lz:是ins文件
學(xué)習(xí)學(xué)習(xí) 呵呵~~
我真的是外行,確認(rèn)一下,
是不是用用platon把ins文件打開(kāi),點(diǎn)sqeeze命令,產(chǎn)生sqf文件,用記事本把sqf文件打開(kāi),將其中文字copy到cif文件的末尾?
謝謝!
是把其中的一部分考進(jìn)去
不是全部
例如產(chǎn)生的sqf是這樣的:# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
_platon_squeeze_void_nr
_platon_squeeze_void_average_x
_platon_squeeze_void_average_y
_platon_squeeze_void_average_z
_platon_squeeze_void_volume
_platon_squeeze_void_count_electrons
_platon_squeeze_void_content
1 0.000 0.000 -0.010 845 57 ' '
2 0.000 0.500 -0.048 22 1 ' '
3 0.500 0.000 0.285 22 1 ' '
4 0.500 0.500 0.618 21 1 ' '
_platon_squeeze_details
;
;
在cif中這行后面:
_refine_ls_shift/su_mean 0.000
考入:
loop_
_platon_squeeze_void_nr
_platon_squeeze_void_average_x
_platon_squeeze_void_average_y
_platon_squeeze_void_average_z
_platon_squeeze_void_volume
_platon_squeeze_void_count_electrons
_platon_squeeze_void_content
1 0.000 0.000 -0.010 845 57 ' '
2 0.000 0.500 -0.048 22 1 ' '
3 0.500 0.000 0.285 22 1 ' '
4 0.500 0.500 0.618 21 1 ' ',