如何求酶促反應(yīng)中最大反應(yīng)速度?單位是什么?
問題:對于一個酶促反應(yīng),通常由米氏方程求米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度以及催化反轉(zhuǎn)常數(shù),可是有關(guān)數(shù)據(jù)只是底物一系列濃度及所對應(yīng)的吸光度值,請問如何求出米氏常數(shù)?尤其是這個最大反應(yīng)速度的單位不好確定? 我是不是還缺少條件?文獻(xiàn)都是10^-8 M s^-1,這個如何得出?謝謝各位了。
[ Last edited by xjx11228 on 2010-6-9 at 16:34 ]
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
你的吸光度值【A】不能直接用作求算最大反應(yīng)速度的參數(shù),而是應(yīng)該轉(zhuǎn)換成產(chǎn)物濃度【Y】mol/L(這一步用標(biāo)準(zhǔn)曲線就可以得出),通過短時間t內(nèi)的產(chǎn)物濃度的變化求出初反應(yīng)速度r0,(mol/L.s)。假設(shè)你的底物濃度為【S】,則將底物濃度的倒數(shù)1/[S]作為橫坐標(biāo),將反應(yīng)初速度的倒數(shù)1/r0作為縱坐標(biāo)作圖,做出來的圖上面就有最大反應(yīng)速度和米氏常數(shù)這類的參數(shù)了,單位就是mol/(L.s)
非常謝謝你的回答。方法是對的?墒怯幸稽c(diǎn)還不明白。由A轉(zhuǎn)換為濃度時由標(biāo)準(zhǔn)曲線來計算產(chǎn)物濃度。關(guān)鍵是這個產(chǎn)物濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線如何制得?還是用同一組數(shù)據(jù)?
如HRP對TMB底物的米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度:
TMB濃度 Absorbance
1 0.034
2 .....
3 .....
4
5
6
產(chǎn)物的濃度如何得到?測得A是底物氧化后產(chǎn)物的,是否由化學(xué)反應(yīng)方程式得出。這樣一來吸光度數(shù)值就沒有用了。
是否有其它轉(zhuǎn)換方法呢?用吸光度肯定不對,否則計算單位不對
,
求助中。。。。。。。。。
所謂的標(biāo)準(zhǔn)曲線就是你的產(chǎn)物Y的濃度在你那臺分光光度計上的吸光值A(chǔ)之間的對應(yīng)關(guān)系,其實(shí)跟你的底物濃度沒有關(guān)系。也就是你配置一定濃度的產(chǎn)物(這個需要用純品,分析純的即可),測定每個濃度下的吸光值,做一條直線,就是你的標(biāo)準(zhǔn)曲線,就是說產(chǎn)物濃度Y和吸光值A(chǔ)之間形成了一種關(guān)系:A=a+bY,這樣你用你的底物反應(yīng)完之后的反應(yīng)液測得的吸光度,實(shí)際上對應(yīng)著你的反應(yīng)液里有多少產(chǎn)物,根據(jù)你標(biāo)準(zhǔn)曲線的方程計算就出來了,這樣吸光值不就有用了嗎。總結(jié)來說,標(biāo)準(zhǔn)曲線就是建立一個吸光值與產(chǎn)物濃度的關(guān)系,明白了嗎?
這種標(biāo)準(zhǔn)曲線的做法是放之四海而皆準(zhǔn)的,多看看書上的介紹你就可以發(fā)現(xiàn),幾乎所有的標(biāo)準(zhǔn)曲線都是建立一種目標(biāo)產(chǎn)物濃度與檢測值之間的關(guān)系,從而能根據(jù)實(shí)際樣品的檢測值來計算目標(biāo)產(chǎn)物濃度,呵呵
補(bǔ)充一點(diǎn),你只需要測定一條標(biāo)準(zhǔn)曲線(一系列濃度的產(chǎn)物濃度和吸光值的關(guān)系)A=a+bY
然后根據(jù)你舉的例子中的吸光值計算出對應(yīng)的一系列產(chǎn)物濃度,即可得到:
TMB濃度 產(chǎn)物濃度
1 Y1
2 Y2
……
如果你以TMB為底物的時間夠短的話(設(shè)為t),則你需要求算米氏常數(shù)的反應(yīng)初速度為Y/t, 單位mol/(L.s),對應(yīng)不同的底物濃度,就對應(yīng)有一定的反應(yīng)初速度,則:
TMB R
1 r1
2 r2
……
再往下你就會了吧
哦,我懂了,如果我沒有底物氧化產(chǎn)物的純品,就無法得出最大反應(yīng)速度了。如TMB,還要求做聯(lián)苯醌的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖,從而求對應(yīng)的反應(yīng)速度。可是這個聯(lián)苯醌的純品有沒有賣的呢?
如果有名字的話,應(yīng)該是有賣的,呵呵,你可以看看相關(guān)文獻(xiàn),祝你成功