【求助】如何重新合并 Friedel data
昨天投的ACTA E今天編輯回信了：
意見如下：Mo Ka measured Friedel data cannot be used to determine absolute structure in a light atom study. Accordingly, you will need to merge the Friedel data and re-refine the structure.
哪位熱心的蟲子幫忙看看如何解決，謝謝啦！
本人不是學晶體的，希望能講一些具體的操作。
[ Last edited by hapwave on 2010-9-2 at 13:59 ]
返回小木蟲查看更多
今日熱帖
京公網(wǎng)安備 11010802022153號
重新還原數(shù)據(jù)。
參與下 merg 2
Mo靶不行換Cu靶。
在ins文件中加入“merge 3" 精修，把用'merge 2"精修2次所得的_refine_ls_number_reflns xxx
相減就可以得到一個“_refine_ls_abs_structure_details
'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881， xxx Friedel pairs'
_refine_ls_abs_structure_Flack unk 加入到cif文件中。
[ Last edited by ljmmarise on 2010-9-2 at 17:52 ]
我的化合物原料 構(gòu)型是已知的， 能不能根據(jù)這個 推斷產(chǎn)物的構(gòu)型呢？
請問merg 2或3或4有何區(qū)別？
3. 如果絕對構(gòu)型確定不了怎么辦?
有時候, 由于沒有>Si的重原子, 或Friedel pairs的數(shù)目不夠多, 或者是racemic twin, 結(jié)果flack 參數(shù)沒有靠近0,而且偏差大, 比如 0.49(13). 這時候, 絕對構(gòu)型無法靠反常散射來確定, 那么, Friedel pairs要被合并掉, 具體如下.
1). 在.ins中加 merg 3, 精修到收斂
2). 在CIF中加
_chemical_absolute_configuration unk
在CIF中刪去
_refine_ls_abs_structure_details 'Flack (1983), 1283 Friedel pairs'
_refine_ls_abs_structure_Flack ?
3). 要在refine special一欄說明絕對構(gòu)型不確定的原因，
一般mo靶精確地不如cu靶高，但如果你的晶體里沒有金屬等重原子或晶體比較小的話要選擇cu靶來測！不好意思對于5L的我還沒有遇到過這種問題。你的化合物構(gòu)型已知的話可以把它的構(gòu)型在你解晶體的時候作為指導，但不能作為晶體解析時的全部指導，因為在長晶體的時候構(gòu)型是否改變還需要解出來之后再對比確定。如果你的數(shù)據(jù)自己不能搞定的話建議你直接找xi2004老師或大神人老師來處理，因為編輯給你的時間不多，你的壓力也比較大！