【求助】請教卟吩環(huán)的問題
請教蟲友：
卟吩加上支鏈變成卟啉，卟啉再加上支鏈加上鎂變成葉綠素，這期間進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，原始的卟吩環(huán)在結(jié)構(gòu)上變化大嗎？鍵長、鍵角變化有多大？
即能否固定原始的卟吩環(huán)的坐標不變，而只優(yōu)化隨后加上去的支鏈？
也即雖然原始的卟吩環(huán)的坐標不能變，但它的影響甚小，電荷分布還是會隨著加上去的支鏈而變化，使卟吩環(huán)的坐標不能變轉(zhuǎn)化為系統(tǒng)誤差？
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
所述方法毫無疑問可以用來加快分子穩(wěn)定構(gòu)型的搜索。但用這一方法得到整個大分子的穩(wěn)定構(gòu)型后，還得作一次全局優(yōu)化，否則就得看審稿人的臉色啦（我有一位同事就遇到過這樣的問題），
不知道總的計算體系有多少原子 多少重原子，LZ所述方法在我看來適合機理猜測以及印證實驗，如果真的要發(fā)文章的話，建議你對全模型進行計算，減少計算量的方法可以通過使用混合基組，ONIOM等完成。高檔次的雜志，reviewer很挑剔。