求助生物專業(yè)蟲友:詳細(xì)查詢蛋白二級結(jié)構(gòu)的方法
我做了紅外,并對改蛋白的二級結(jié)構(gòu)進行了分析,現(xiàn)在想在數(shù)據(jù)庫中進行比對,但是在PDB等數(shù)據(jù)庫中看到的是該種蛋白的三級結(jié)構(gòu),所以特向蟲友請教如何查找特定蛋白的二級結(jié)構(gòu)(螺旋、折疊等信息),因為非生物學(xué)專業(yè),煩請詳細(xì)指教,謝謝
返回小木蟲查看更多
今日熱帖
我做了紅外,并對改蛋白的二級結(jié)構(gòu)進行了分析,現(xiàn)在想在數(shù)據(jù)庫中進行比對,但是在PDB等數(shù)據(jù)庫中看到的是該種蛋白的三級結(jié)構(gòu),所以特向蟲友請教如何查找特定蛋白的二級結(jié)構(gòu)(螺旋、折疊等信息),因為非生物學(xué)專業(yè),煩請詳細(xì)指教,謝謝
返回小木蟲查看更多
京公網(wǎng)安備 11010802022153號
https://au.expasy.org/tools/里面有蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的
zhou-Fassman 方法是用于判斷二級結(jié)構(gòu)的方法,zhou,是中國人,鄒承魯先生
非常感謝您的幫助,我已經(jīng)按照這個方法做了二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,但是如何得到比如螺旋、折疊等二級結(jié)構(gòu)所占的比例那?請指教,謝謝
比如說這個結(jié)果
Total Residues: H: 579 E: 484 T: 127
Percent: H: 58.6 E: 49.0 T: 12.9
為什么沒有無規(guī)卷曲的比例
另外這個百分率是大于100的
,
interpro是個綜合性的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫,集成了很多二級結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,比如pfam, prints 。。。
EMBOSS是個免費的生物信息軟件包,里面也有很多預(yù)測二級結(jié)構(gòu)的軟件
內(nèi)容已刪除
內(nèi)容已刪除