FRET里accpetor熒光強度太低
我設(shè)計了個FRET實驗觀察兩個蛋白相互作用,一個用Fluorescein(donor)標(biāo)記了,另一個用TAMRA(acceptor)標(biāo)記.
在誘導(dǎo)相互作用以后,我可以明顯地看到fluorescein(donor)熒光強度下降了50%-70%, 但是TAMRA(acceptor)的熒光根本觀察不到
后來我直接用acceptor的激發(fā)波長激發(fā)acceptor,發(fā)現(xiàn)acceptor的熒光亮度僅僅是donor熒光亮度的1/8到1/10,估計是熒光轉(zhuǎn)化效率太低,兩個放在一起就被donor的熒光蓋住了,(donor在acceptor的發(fā)射波長范圍也有很弱的熒光)
有沒有什么辦法能夠降低donor的熒光效率,或者證明FRET確實發(fā)生了?因為我要是把這樣的結(jié)果給審稿人,審稿人看不到acceptor的變化,肯定不相信我的數(shù)據(jù)啊
我想能不能把TAMRA(acceptor)給光漂白了,嘗試觀察Fluorescein(donor)的重新上升?有親這么做過嗎?
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補充一下,我有做過陰性對照,把只有donor標(biāo)記的蛋白和未標(biāo)記的蛋白誘導(dǎo)相互作用,看不到熒光變化,
熒光強度低有可能是合成的熒光蛋白質(zhì)量有問題吧? 建議換一種波長和donor相距較遠(yuǎn)的
同樣遇到一樣的問題。我的是Cy3-Cy5 分子對,Cy5熒光強度非常低,