2016年中國“DNA條形碼和下一代(next generation)分子標(biāo)記的開發(fā)及利用”
2016年中國“分子鑒定原理及應(yīng)用——“DNA條形碼和下一代(next generation)分子標(biāo)記的開發(fā)及利用”
時(shí)間:2016.5.5-2016.5.8
主辦單位:中國科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所 北京海淀中科計(jì)算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心
培訓(xùn)地點(diǎn):武漢 武漢大學(xué)
官方網(wǎng)址:https://ec.ict-ttc.com
隨著分子生物學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)的發(fā)展,分子鑒定應(yīng)用領(lǐng)域越來越廣泛,其中基于DNA 條形碼技術(shù)、基因組技術(shù)等進(jìn)行鑒定和分類的研究已成為生物分類學(xué)研究中引人注目的新方向和研究熱點(diǎn)。DNA條形碼、基因組等技術(shù)的出現(xiàn)極大地增強(qiáng)人類監(jiān)測、了解和利用生物多樣性資源的能力,其在生命科學(xué)、法醫(yī)學(xué)、流行病學(xué),以及醫(yī)藥、食品質(zhì)量控制等領(lǐng)域均具有廣泛的應(yīng)用前景!爸悄苄畔⑻幚砑夹g(shù)”為人力資源與社會保障部中國科學(xué)院北京分院國家級專業(yè)技術(shù)人員繼續(xù)教育基地培訓(xùn)點(diǎn)培訓(xùn)項(xiàng)目,“生物信息”為智能信息處理技術(shù)系列培訓(xùn)項(xiàng)目之一。為進(jìn)一步推動我國生物信息學(xué)的發(fā)展,提高從業(yè)人員的技術(shù)水平,北京海淀中科計(jì)算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心(中科院計(jì)算所技術(shù)轉(zhuǎn)移中心)舉辦“生物信息學(xué)最新技術(shù)”暨“分子鑒定原理及應(yīng)用——“DNA條形碼和下一代(next generation)分子標(biāo)記的開發(fā)及利用”高級培訓(xùn)班,并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦,具體事宜通知如下
一 、分子鑒定的應(yīng)用
1、微生物、動物、植物資源普查
2、檢驗(yàn)檢疫
3、中藥材真?zhèn)舞b定
4、食品質(zhì)量安全
5、疾病診斷和預(yù)防
6、分子育種
二、DNA測序技術(shù)-遺傳檢測的利器
1、第一代測序技術(shù):Sanger測序原理
2、第二代測序技術(shù):Illumina,454, Ion Torrent原理
3、第三代測序技術(shù):PacBio, Hellicos原理
4、第四代測序技術(shù): Oxford NanoPore原理
5、Hybridization based methods
6、測序技術(shù)的比較及展望
三、Sequence-independent分子標(biāo)記的開發(fā)及應(yīng)用
1、Restriction fragment length polymorphism (RFLP)
2、Random amplified polymorphic DNA (RAPD)
3、Simple sequence repeats (SSR)
4、Single strand conformation polymorphism (SSCP)
5、Cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS)
6、Sequence characterized amplified region (SCAR)
7、Amplified fragment length polymorphism (AFLP)
8、Inter-retrotransposon amplified Polymorphism (IRAP)
9、REtransposon-microsatellite amplified polymorphism (REMAP)
四、equence-dependent分子標(biāo)記開發(fā)及應(yīng)用
1、常用的DNA條形碼標(biāo)記:ITS,ITS1,ITS2,trnH-psbA,rbcL-matK,COI等
2、常用DNA條形碼鑒定方法:sequence similarity-based (Blast, Hidden Markov Model),tree-based,cutoff-based
3、篩選最優(yōu)DNA條形碼指標(biāo)
⑴PCR amplification success
⑵Sequencing efficiency
⑶Species distinguishing power
⑷DNA barcoding gap
DNA barcoding相關(guān)數(shù)據(jù)庫
⑴BOLD: Barcode of Life Database
⑵BOMMD: Barcode of Medicinal Materials Database
五、基于全基因組序列的新的分子標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)
1、(真菌、動物)線粒體基因組
⑴測序方案: 實(shí)驗(yàn)方法純化還是生信方法純化
⑵組裝方法:de novo vs. reference based
⑶注釋流程: MFAnnotator vs. FUMGA
⑷特異性標(biāo)記篩選流程
2、(植物)葉綠體基因組
⑴測序方案:實(shí)驗(yàn)方法純化還是生信方法純化
⑵組裝方法:de novo vs. reference based
⑶注釋流程:CPGAVAS vs. DOGMA
⑷特異性標(biāo)記篩選流程
六、物理圖譜和遺傳圖譜構(gòu)建新方法:原理及應(yīng)用
1、Optical Map
2、Bionano
3.reduced-representation sequencing using reduced-representation libraries (RRLs)
4、complexity reduction of polymorphic sequences (CRoPS),
5、Restriction-site associated DNA sequencing (RAD-Seq)
培訓(xùn)注冊:(郵箱報(bào)名:hdzkyjsjs@163.com) 聯(lián)系電話:張老師 :17310133545
培訓(xùn)班日期(5月5日-5月8日)
1.注冊費(fèi):4300元/人;
(包括培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、考試費(fèi)、證書費(fèi),食宿統(tǒng)一安排,費(fèi)用自理)
2.團(tuán)體優(yōu)惠:同一單位有四位學(xué)員參加,可免費(fèi)贈送一位聽課名額;
3.本培訓(xùn)人數(shù)限制為40人,報(bào)滿截止;
4.座位按照注冊付款先后排列,敬請諒解!
[ Last edited by 為人誠信 on 2016-4-6 at 14:02 ]
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名額有限,火速報(bào)名哈
小蟲蟲里沒有對DNA條形碼感興趣的嗎?
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