請問用T-RFLP技術處理樣品后,怎么分析數據
最近做用T-RFLP技術測定了污染物對不同土壤細菌多樣性的影響,但沒有測序沒有建庫,得到的只是片段信息,而且也不打算建庫了,得到數據后本小弱不會分析,根據查到的文獻,對大概可以進行的分析總結了下,主要有香濃和辛普森指數分析,主成分分析,以及不同樣品中細菌相似度的分析,另外還可以根據網上的比對信息推測細菌的種屬,但不知道還有什么分析可以做?而且小弱以前沒做過這個,數據分析的具體操作不懂唉,有沒有蟲友能提供幫助,推薦幾款軟件和網站啥的,在下感激不盡
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京公網安備 11010802022153號
自己頂,別沉,還有個問題想補充下,算多樣性之前需要將長度小于50bp,豐度小于1%的片段都去掉?還是只去掉小于50的片段就可以了,豐度小于1%的片段需要保留呢?
T-RFLP 的試驗我們可以提供服務,關于分析大致也就您說的這些了。
謝謝
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