如何解讀NCBI上BLAST的結(jié)果
脟毛脦脢賂梅脦祿麓貿(mào)脡帽攏盧脦脪脮媒脭脷脳枚虜隆脭顱戮煤錄酶露簍攏盧脧脰陸脳露脦脪脩戮顱脥錨魯脡虜隆脭顱戮煤碌脛路脰脌毛鹿隴脳梅攏盧虜壟脟脪脤謾脠隆脕脣虜隆脭顱戮煤攏簍脰梅脪陋脢脟脮忙戮煤攏漏DNA攏盧虜壟脟脪露脭ITS陸酶脨脨脕脣虜芒脨貌隆攏碌蘆脢脟脭脷NCBI脡脧BLAST脰廬潞貿(mào)碌脛陸謾鹿沒虜?shù)撁屘J祿謾陸芒露脕隆攏脰梅脪陋脫脨脪脭脧脗錄賂賂枚脦脢脤芒攏潞
1.隆擄Query cover隆鹵脰碌潞脥隆擄Ident隆鹵脰碌露錄脧脿碌脠攏盧碌蘆脢脟陸謾鹿沒脠麓虜?shù)撁徝犆嵄R攏盧脫脨脢鹵潞貌脢脟脥盧脢么碌脛虜?shù)撁嵄R脰脰攏盧脫脨脢鹵潞貌脡玫脰脕虜?shù)撁嵄R脢么攏盧脮芒脰脰脟茅驢枚脫婁賂脙脭玫脙麓麓婁脌鉚攏驢
2.脫脨脢鹵潞貌隆擄Query cover隆鹵脰碌潞脺賂脽碌蘆脢脟隆擄Ident隆鹵脰碌碌脥攏盧祿貌脮脽隆擄Query cover隆鹵脰碌潞脺碌脥碌蘆脢脟隆擄Ident隆鹵脰碌賂脽攏盧脮芒脰脰脟茅驢枚脧脗賂脙脫脜脧脠?bào)H錄脗脟擄麓賂枚脰碌脛脴攏驢
3.BLAST陸謾鹿沒碌脛脳脭露爐脜脜脕脨脣魯脨貌脢脟擄麓脢虜脙麓脌麓碌脛攏驢脳脭露爐脜脜脕脨脣魯脨貌碌脛脧脠潞貿(mào)脫脨虜脦驢錄錄脹脰碌脙麓攏驢
[img]https://~YGZJKAT1@C[V3_{$J7EG}X.png[/img]
脟貿(mào)陸芒麓冒~
脣魯鹵茫脦脢脪祿脧脗攏盧脦壟脡煤脦茂碌脛脨脦脤盧錄酶露簍脰脨攏盧脦脪碌脛虜驢路脰虜隆脭顱戮煤脭脷脜脿脩酶脙貿(mào)脰脨脰祿魯隴戮煤脣驢攏盧脙祿脫脨忙脽脳脫攏盧脮芒脩霉碌脛脟茅驢枚脭玫脙麓擄矛脛脴攏驢

~YGZJKAT1@C[V3_{$J7EG}X.png
返回小木蟲查看更多
京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
1,你是雙向測(cè)序么,雙向測(cè)了的話,不要太相信公司給你的拼接結(jié)果,最好自己把兩個(gè)序列比對(duì)一下,看拼接的準(zhǔn)確率。
2,建議再多做一到兩個(gè)基因。
3,你適當(dāng)減少培養(yǎng)基中C源含量
脨祿脨祿脛煤碌脛祿脴麓冒~
脦脪脳枚碌脛脢脟虜隆脭顱戮煤碌脛錄酶露簍隆攏驢麓脦脛脧脳脌茂錄酶露簍虜隆脭顱戮煤露錄脢脟脫脙ITS脨貌脕脨錄酶露簍隆攏脟毛脦脢露脿脳枚錄賂賂枚祿霉脪貌碌脛祿擄攏盧脢脟脪陋錄脫脛脛錄賂賂枚鹵脠陸脧潞脧脢脢脛脴攏驢
脦脪脧脰脭脷脢脟脙驢麓脦鹵脠露脭脟擄攏盧脧脠擄脩脮媒脧貌隆壟路麓脧貌隆壟脝麓陸脫碌脛脠媒脤玫鹵脠露脭攏盧脠祿潞貿(mào)擄脩脢脮脦虜虜?shù)撁幟埪逗t碌脛露錄脠樓碌么攏盧脠祿潞貿(mào)脭脵BLAST隆攏脛煤驢麓脮芒脩霉脳枚驢脡脪脭脙麓攏驢
C脭麓碌脛祿擄攏盧脧脰脭脷脫脙碌脛脢脟PDA脜脿脩酶祿霉攏盧脝脧脤脩脤脟錄脫20g/L攏盧賂霉戮脻脛煤碌脛戮顱脩茅攏盧錄玫碌陸露脿脡脵鹵脠陸脧潞脧脢脢脩陸攏驢脪脭錄擄攏盧錄玫脡脵C(jī)脭麓碌脛脛驢碌脛脢脟脢虜脙麓脛脴攏?br>,