[優(yōu)秀文章推薦]上海交通大學(xué)揭示玉米直鏈淀粉含量的遺傳結(jié)構(gòu)研究
該研究通過全基因組關(guān)聯(lián)分析系統(tǒng)研究了玉米籽粒中表型直鏈淀粉的含量與單核苷酸多態(tài)性的基因型的連鎖研究,篩選出了與直鏈淀粉合成相關(guān)的關(guān)聯(lián)SNPs以及有潛力的候選基因,為遺傳調(diào)控研究玉米淀粉含量和品質(zhì)改良提供了重要線索。
淀粉是植物體內(nèi)貯藏的高分子碳水化合物,富含淀粉的植物主要包括蕨類、殼斗科、禾本科、蓼科和百合科等。其中,禾本科玉米淀粉是人類主要的淀粉來源之一,也是工業(yè)淀粉和以淀粉為原料的深加工產(chǎn)業(yè)主要原料,美國淀粉加工業(yè)中9 5%的淀粉都是玉米淀粉。普通淀粉顆粒內(nèi)支鏈淀粉約占80%,直鏈淀粉約占20%。直鏈淀粉是一種由D-吡喃葡萄糖組成的線性聚合物,各葡萄糖單體主要以α-1,4-糖苷鍵連接,每個直鏈淀粉分子通常含有數(shù)千個葡萄糖單體。
淀粉是玉米籽粒中含量最豐富的碳水化合物,主要包含了25%直鏈和75%左右的支鏈淀粉。跟總淀粉含量不同的是,直鏈和支鏈淀粉的各自所占的百分含量決定了食品原料和工業(yè)應(yīng)用中不同的加工性能。越來越多的研究興趣轉(zhuǎn)移到遺傳控制單個直鏈或支鏈淀粉含量上,而它們生物合成的酶反應(yīng)機(jī)器仍不完全清楚。
該團(tuán)隊(duì)利用了464株玉米籽粒中表型直鏈淀粉的含量,以及對應(yīng)的9,007,194 SNPs的基因型,進(jìn)行連鎖不平衡的全基因組關(guān)聯(lián)分析,篩選出了與直鏈淀粉合成相關(guān)的27個SNPs以及有潛力的39個候選基因,這些結(jié)果初步闡明了直鏈淀粉合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對后續(xù)研究和改良玉米籽粒具有重要指導(dǎo)意義。
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通過全基因組關(guān)聯(lián)分析系統(tǒng)研究了玉米籽粒中表型直鏈淀粉的含量與單核苷酸多態(tài)性的基因型的連鎖研究,篩選出了與直鏈淀粉合成相關(guān)的關(guān)聯(lián)SNPs以及有潛力的候選基因,為遺傳調(diào)控研究玉米淀粉含量和品質(zhì)改良提供了重要線索,
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