用ONIOM關(guān)鍵詞算吸收,請問可以看分子軌道嗎?
用ONIOM關(guān)鍵詞算吸收,請問可以看分子軌道嗎?得到的chk文件轉(zhuǎn)化成fchk文件會造成數(shù)據(jù)丟失,在Gaussview里無法打開。
輸入文件:
%chk=packing1_guest_abs_ONIOM.chk
%nprocshared=20
%mem=12000MB
#p oniom(PBE1PBE/genecp td=(singlets,nstates=20,direct):uff)=embedcharge test
absorption
0 1 0 1 0 1
C 26.8564499443,11.2974579201,22.535374973 L
C 26.4312706227,12.5897273583,22.1656391631 L
C 25.079756231,12.9545921491,22.2751903325 L
C 24.1694372817,11.9921553489,22.7275839214 L
C 24.5970630014,10.7317662379,23.1036871816 L
C 25.9390511173,10.3569276904,23.0333609336 L
H 27.8993300059,11.0327314821,22.4387729637 L
中間略到好多原子
C 33.1316875537,25.2458454493,20.5017776507 L
H 34.6438528841,23.5215656048,22.9626666632 L
H 34.5537458777,23.6020072384,20.5486274853 L
C 33.0912226367,25.4397359482,19.0253450849 L
O 33.7582638392,24.7213374764,18.3023322806 L
O 32.3461046073,26.4006128366,18.4698156726 L
C H N O 0
6-31G**
****
Ir 0
LANL2DZ
****
Ir 0
LANL2DZ
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
你的輸出文件明明顯示是用G16 C01計算的。但是你為什么要加載G16 A03去進(jìn)行formchk? 這肯定不行的呀。你要注意版本 要 一模一樣。
非常感謝老師,我一定銘記于心!
chk文件已轉(zhuǎn)換成fchk文件
fchk文件用GaussView打開,顯示有問題,請問這是什么原因?
1592817157(1).jpg
這是因為你用的GV6.06版本去打開 G16 C.01 計算出來的fchk就會出現(xiàn)此類錯誤。原則上你應(yīng)該用最新的GV6.11版本才可以正常打開。
但是這個問題不是沒法搶救一下。
在這個彈出錯誤窗口后, 你需要點了ok之后選擇用記事本打開這個文件。這時候就會定位到出錯的那行。你會看到寫著 MM Charges 的地方。這時候你需要把 最后的那個s刪掉 然后記得一定要打一個空格代替那個s的位置, 也就是 把 MM charges 變成 MM charge 保存就可以了 然后再打開就可以了。
好的,非常感謝老師!
我進(jìn)行操作之后是顯示關(guān)鍵詞錯誤,想請教一下這怎么解決啊,謝謝老師!
1592898772(1).jpg
我算了一下 轉(zhuǎn)換過程如動圖 沒有問題可以打開. 而且轉(zhuǎn)換完的文件開頭如圖2 。不知道你這截圖里的那行關(guān)鍵詞哪里來的
修改fchk.gif
圖2
謝謝老師,我把關(guān)鍵詞那行都刪了 同時按照您的方法改就解決了!
謝謝老師的指點,辛苦啦!
借一下樓,老師您好,我想得到得到激發(fā)態(tài)的HOMO-LUMO圖和數(shù)據(jù),我用oniom得到激發(fā)態(tài)的結(jié)果后在怎么做單點計算,我之前是把qm分子坐標(biāo)拿出來做,但明顯不對,這樣就無法考慮分子間的作用力。圖一是我做的激發(fā)態(tài)的結(jié)果,圖二是之前單獨拿出qm分子算的單點計算,明顯不對。要怎樣寫命令和輸入文件才可以,我剛接觸計算不久,還請老師多多指點,感謝!
圖二.png
圖一.png
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