lamp引物序列本身的特異性怎么分析
怎么在NCBI或者其他軟件上分析LAMP引物序列本身的特異性？
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
可以在primer blast里面輸入自己的外引物試試，但是內(nèi)引物太長了，好像不行
可以Bowtie比對一下
bowtie可以針對FIP/BIP進(jìn)行直接分析嗎？FIP/BIP的設(shè)計(jì)不是通過2段接到一起的嗎？還是說需要分開進(jìn)行單獨(dú)分析？
我對于FIP/BIP是采用就是設(shè)計(jì)的時候接起來的方法把它單獨(dú)分開來，通過NCBI的Primer Blast的里面進(jìn)行一個nr的blast，然后看引物的單獨(dú)的特異性好不好。因?yàn)長AMP是2對引物共同作用，如果引物只要有一個存在問題，那么擴(kuò)增就會存在很大問題，所以說從引物的作用角度來分析我覺得好像特異性蠻高。但是容易出現(xiàn)假陽性擴(kuò)增，這點(diǎn)是不是又可以說引物本身特異性不好？
還希望有大佬看到給我個回復(fù)，小弟才初入LAMP，很多東西還不是很懂~~
請問有解決方法了嗎
，