理論計(jì)算化學(xué)Gaussian》、《GROMACS分子動(dòng)力學(xué)》、《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)》通知
本次特安排暑期系列課程，在線直播教學(xué)結(jié)合線下面對(duì)面實(shí)訓(xùn)
一、理論計(jì)算化學(xué)Gaussian（每個(gè)知識(shí)點(diǎn)均結(jié)合實(shí)例練習(xí)）
1、理論計(jì)算化學(xué)簡(jiǎn)介—初識(shí)并掌握相關(guān)量子化學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)，了解不同理論方法和基組
2、Gaussian及GaussView操作基礎(chǔ)及應(yīng)用—經(jīng)過(guò)實(shí)際課堂任務(wù)計(jì)算，掌握程序畫(huà)圖和提交任務(wù)
3、Gaussian基礎(chǔ)操作Ⅰ：—掌握文章中初級(jí)結(jié)構(gòu)示意圖的輸出
4、Gaussian基礎(chǔ)操作Ⅱ—各個(gè)小節(jié)進(jìn)行相應(yīng)的實(shí)際計(jì)算
5、Gaussian進(jìn)階操作ⅠⅡ：—各個(gè)小節(jié)進(jìn)行相應(yīng)的實(shí)際計(jì)算
6、7Gaussian計(jì)算專(zhuān)題I—反應(yīng)熱力學(xué)性質(zhì)計(jì)算—評(píng)估反應(yīng)計(jì)算—模擬文獻(xiàn)計(jì)算方法—靜電勢(shì)及預(yù)測(cè)位點(diǎn)計(jì)算
二、GROMACS分子動(dòng)力學(xué)（每個(gè)知識(shí)點(diǎn)均結(jié)合實(shí)例練習(xí)）
1、力場(chǎng)文件的建立、修改方法實(shí)踐
2、各種數(shù)據(jù)分析方法實(shí)踐
3、純相、多相混合體系；界面；物理場(chǎng)下，混合體系、石墨烯、納米管模擬計(jì)算
4、傘形采樣——計(jì)算結(jié)合自由能
5、藥物分子開(kāi)發(fā)溶劑篩選
6、固/晶體建模仿真、結(jié)構(gòu)變化分析
7、磷脂雙分子層生物膜建模
9、學(xué)員感興趣的相關(guān)問(wèn)題
三、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)（每個(gè)知識(shí)點(diǎn)均結(jié)合實(shí)例練習(xí)）
1、生物分子互作基礎(chǔ)
2、蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白結(jié)構(gòu)分析
3、同源建模、小分子構(gòu)建
4、小分子化合物庫(kù)
5、生物分子互作用Ⅰ分子對(duì)接軟件（Autodock或薛定諤) 使用
6、虛擬篩選
7、生物分子互作用II預(yù)測(cè)蛋白-蛋白相互作用（ZDOCK或DS中的ZDOCK模塊）
8、構(gòu)效關(guān)系分析 3D-QSAR模型構(gòu)建（Sybyl軟件）
9、分子動(dòng)力學(xué)模擬：Gromacs 進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬-結(jié)果分析-結(jié)合自由能計(jì)算。
詳情鏈接可看 https://icesci.cn/hdp/2020/0701/0205106.html 返回小木蟲(chóng)查看更多