Western Blot進階技巧第一彈——從了解目的蛋白開始
蛋白質(zhì)印跡 (Western Blot),相信大家對此都不陌生,做為檢測蛋白表達及半定量的基礎(chǔ)實驗方法,也是很多小伙伴們初入實驗室的第一門課。
“上手容易,精通難”可謂對WB實驗的最佳注釋,初入實驗室的“菜鳥”可以很快上手,做出漂亮的條帶,做過多年的“大神”也可能一著不慎,實驗“翻車”,結(jié)果一塌糊涂。有些實驗室甚至流傳著一些所謂的“玄學(xué)”,新手人品好,難做的條帶給新手做等等。
真的是這樣么?實驗技術(shù)可不是拼人品,靠運氣的事兒,接下來小編將會為大家?guī)鞼B進階技巧系列,干貨滿滿,讓大家提升WB實驗技巧,成為真正的實驗“大神”。
首先,讓我們了解一下什么是WB實驗吧:
▲【定義】WB又稱為免疫印跡 (immune blot) ,是根據(jù)抗原抗體的特異性結(jié)合半定量的檢測樣品中的某種蛋白的方法。
▲【原理】通過凝膠電泳,將不同分子量大小的蛋白質(zhì)分離開,再利用特異性抗體對凝膠電泳處理過的細(xì)胞或生物組織樣品進行著色。通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細(xì)胞或組織中表達情況的信息。
▲【應(yīng)用】定性檢測:目標(biāo)蛋白有無,分子量大;定量檢測:檢測目標(biāo)蛋白含量(半定量)。

圖1. WB操作流程圖
看到這,相信之前對WB了解不多的同學(xué)也應(yīng)該對WB有了一個基礎(chǔ)的認(rèn)識。那么,怎樣可以把這看似簡單的幾步做好,拿到漂亮的實驗結(jié)果呢?話不多說,上干貨。
小編首先要強調(diào)的一點,就是了解目的蛋白,這也是今天這篇文章主要給大家分享的內(nèi)容?赡苡械男』锇闀幸蓡,為什么要講一個跟WB操作沒關(guān)系的步驟呢?說好的WB進階呢?其實,這往往是很多新手忽視的關(guān)鍵點,對目的蛋白一知半解,是沒有辦法做好WB實驗的,其他免疫學(xué)實驗也是一樣,可能有的小伙伴還不是特別相信,接下來讓小編帶大家看看為什么了解目的蛋白是如此的重要吧~
了解目的蛋白對整個WB 實驗的重要性:
1.了解目的蛋白,才知道目的蛋白在實驗樣品中是否有表達
WB實驗檢測,很多小伙伴會遇到的問題之一就是無條帶,也就是陰性結(jié)果,如何判斷陰性結(jié)果是實驗操作問題造成的“假陰性”還是本該如此的“真陰性”,這就需要大家在實驗前,就對目的蛋白有一個清晰的認(rèn)識。很多蛋白的表達是有組織特異性的,例如IL-10R,在視網(wǎng)膜,脾臟和肺腺癌組織中有高表達,其他組織表達含量較低;還有一些蛋白,則需要特定的刺激條件才會高表達,這種情況往往在磷酸化蛋白及炎癥因子蛋白等中較為常見,如果未做特殊的處理,目的蛋白表達含量很低,無法被WB檢測出。
2.了解目的蛋白,才知道如何制備樣本
樣本制備也是WB的關(guān)鍵步驟,后續(xù)的文章中也會為大家詳細(xì)分析。如何選擇合適的樣本制備方法,關(guān)鍵因素就是要了解目的蛋白;除了上面第一步中的要了解目的蛋白表達組織,及預(yù)處理條件外,還需確認(rèn)目的蛋白表達的亞細(xì)胞定位,例如,細(xì)胞膜蛋白,核蛋白,線粒體蛋白和胞漿蛋白的提取方式都不一樣,選擇合適的方式,才能制備合格的樣品,方便后續(xù)的WB實驗。另外一個需要注意的因素就是需要加入對應(yīng)的蛋白酶抑制劑,這一點對于磷酸化的蛋白尤為重要,否則蛋白在提取過程中就被降解,會造成“假陰性”結(jié)果。

3. 了解目的蛋白,才知道如何選擇內(nèi)參
內(nèi)參抗體,是WB實驗中的重要參考,WB可以對目的蛋白進行半定量分析,判斷不同樣品中目的蛋白表達含量的多少,就是取決于內(nèi)參的標(biāo)定。內(nèi)參選擇在WB實驗中是很關(guān)鍵的因素,可不是GAPDH或者β-actin萬用的哦。內(nèi)參如何選擇,最重要的決定因素就是目的蛋白,尤其是目的蛋白的表達位置及預(yù)處理條件。小編在這里總結(jié)了一下內(nèi)參的選擇表,大家可以保存哦~

好了,相信大家應(yīng)該知道實驗前了解目的蛋白的重要性了吧,如何了解目的蛋白呢?可以通過UniProt網(wǎng)站搜尋蛋白的相關(guān)信息,也可以在Pubmed上查閱對應(yīng)的研究文獻,相信聰明的小伙伴們肯定可以做好的,今天的分享就先到這,接下來我們還會分享整個WB操作過程中的細(xì)節(jié),如果您也有實驗心得想分享給大家,歡迎投稿!
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Wb專家。
專家,學(xué)習(xí)了
請教一下,藍藻的膜蛋白有什么方法可以提取嗎,