分子動(dòng)力學(xué)模擬中的相互作用能
為什么我跑完動(dòng)力學(xué)算出來的相互作用能量達(dá)到了幾萬KJ/mol，最低的時(shí)候也有七八千……求各位大神指導(dǎo)下，能量在多少范圍內(nèi)是合理的？
（計(jì)算公式：E總-Ea-Eb）
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不是得吉布斯自由能小于0，才能自發(fā)結(jié)合嗎
不好意思，忘了說是負(fù)的，但是負(fù)的很大。文獻(xiàn)中看到的大多只有負(fù)的幾百KJ/mol
，
一般認(rèn)為配體與受體結(jié)合的構(gòu)象穩(wěn)定時(shí)能量越低，發(fā)生的作用可能性越大，結(jié)合能≤?5.0 kJ/mol
作為篩選標(biāo)準(zhǔn)。