2270bp的片段,一直P不出來,經(jīng)常P出其他東西,有沒有大神指點(diǎn)一下,怎么設(shè)計(jì)引物才能P出來 返回小木蟲查看更多
Takara PS-GXL比較好用
引物設(shè)計(jì)長(zhǎng)一些,降低退火溫度,換酶,南京諾唯贊的高保真酶還是很厲害的~要不要試試?
P不出來全長(zhǎng)基因有多方面的原因。 首先需要考慮的是引物設(shè)計(jì)。對(duì)于比較長(zhǎng)的基因,引物設(shè)計(jì)可以多試幾對(duì)(一般設(shè)計(jì)3~4對(duì),如果自己設(shè)計(jì)有困難可以考慮招公司幫忙設(shè)計(jì)),引物長(zhǎng)度也可以考慮設(shè)計(jì)長(zhǎng)一點(diǎn)(一般不超過35bp); 其次需要考慮的是用來做模版的cDNA質(zhì)量。模版cDNA的質(zhì)量決定了你能不能最終拿到目的基因;有一些基因的表達(dá)量在不同細(xì)胞里面表達(dá)量不同,可以考慮找一個(gè)表達(dá)量高的細(xì)胞來提取RNA,然后做反轉(zhuǎn)錄得到模版cDNA,然后再去PCR; 再次就是PCR所使用的酶。對(duì)于長(zhǎng)片段而言,也許需要用保真度高的PCR酶,我之前用過NEB公司的高保真酶,效果不錯(cuò);如果PCR得到是有錯(cuò)誤序列的片段,可以考慮換酶;如果是P到的是其他的片段,有可能是因?yàn)槟0婊蛘咭镌O(shè)計(jì)的問題; 最后需要考慮的是優(yōu)化PCR的程序。這個(gè)需要自己慢慢去摸索,每個(gè)基因有一些特定的程序,我曾經(jīng)P過3k、4k的片段,也是摸索了很長(zhǎng)時(shí)間。退火溫度、延伸時(shí)間以及循環(huán)數(shù)都是要摸索和優(yōu)化的。PCR是一門很大的學(xué)問,能做好PCR實(shí)驗(yàn),基本上就爬過了生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的第一座大山,其他的實(shí)驗(yàn)會(huì)就會(huì)相對(duì)簡(jiǎn)單一些。最后祝實(shí)驗(yàn)順利,
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Takara PS-GXL比較好用
引物設(shè)計(jì)長(zhǎng)一些,降低退火溫度,換酶,南京諾唯贊的高保真酶還是很厲害的~要不要試試?
P不出來全長(zhǎng)基因有多方面的原因。
首先需要考慮的是引物設(shè)計(jì)。對(duì)于比較長(zhǎng)的基因,引物設(shè)計(jì)可以多試幾對(duì)(一般設(shè)計(jì)3~4對(duì),如果自己設(shè)計(jì)有困難可以考慮招公司幫忙設(shè)計(jì)),引物長(zhǎng)度也可以考慮設(shè)計(jì)長(zhǎng)一點(diǎn)(一般不超過35bp);
其次需要考慮的是用來做模版的cDNA質(zhì)量。模版cDNA的質(zhì)量決定了你能不能最終拿到目的基因;有一些基因的表達(dá)量在不同細(xì)胞里面表達(dá)量不同,可以考慮找一個(gè)表達(dá)量高的細(xì)胞來提取RNA,然后做反轉(zhuǎn)錄得到模版cDNA,然后再去PCR;
再次就是PCR所使用的酶。對(duì)于長(zhǎng)片段而言,也許需要用保真度高的PCR酶,我之前用過NEB公司的高保真酶,效果不錯(cuò);如果PCR得到是有錯(cuò)誤序列的片段,可以考慮換酶;如果是P到的是其他的片段,有可能是因?yàn)槟0婊蛘咭镌O(shè)計(jì)的問題;
最后需要考慮的是優(yōu)化PCR的程序。這個(gè)需要自己慢慢去摸索,每個(gè)基因有一些特定的程序,我曾經(jīng)P過3k、4k的片段,也是摸索了很長(zhǎng)時(shí)間。退火溫度、延伸時(shí)間以及循環(huán)數(shù)都是要摸索和優(yōu)化的。PCR是一門很大的學(xué)問,能做好PCR實(shí)驗(yàn),基本上就爬過了生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的第一座大山,其他的實(shí)驗(yàn)會(huì)就會(huì)相對(duì)簡(jiǎn)單一些。最后祝實(shí)驗(yàn)順利,
NEB的酶,有錢人