鉑催化的氫化加成反應(yīng)過渡態(tài)計算
我想通過gaussian 09w計算鉑催化的油酸(含有一個雙鍵的18碳脂肪酸)的氫化反應(yīng)。目前已經(jīng)完成結(jié)構(gòu)的優(yōu)化和頻率分析，想對過渡態(tài)和反應(yīng)能壘進(jìn)行分析，但是不知道接下來該如何做，求大神指點(diǎn)。我該如何畫gjf文件，氫 鉑和油酸是一個什么樣的狀態(tài)？反應(yīng)機(jī)理如圖。 還有我在哪里可以設(shè)置反應(yīng)的溫度？
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
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具體怎么擺這個最好查查文獻(xiàn)。有沒有人以前算過這個類似的路徑。你學(xué)著畫就行。如果找不到文獻(xiàn)。那你就得自己從反應(yīng)物自己判斷出TS的大概結(jié)構(gòu)�；蛘咄ㄟ^路徑這種平面圖 用你的“化學(xué)直覺”這種有些玄學(xué)的玩意自己判斷一下可能的結(jié)構(gòu)。當(dāng)然可以通過柔性掃描之類的方法幫你“猜”出過渡態(tài)的結(jié)構(gòu)。 比較通用的做反應(yīng)路徑的方法可以參考我這個教程的 1.10節(jié) http://www.gaoyang168.com/t-14242735-1 論壇里也各種討論過過渡態(tài)的問題。可以搜搜，