最近想要表達(dá)蛋白,想要去掉N端的甲硫氨酸,請(qǐng)問哪位高手能指導(dǎo)一二? 返回小木蟲查看更多
你的導(dǎo)師。
細(xì)胞表達(dá)蛋白后,第一個(gè)氨基酸(F-Met)會(huì)被deformylase切除。 然鵝,如果表達(dá)量大,也有出現(xiàn)該殘基不會(huì)全被切除,這個(gè)時(shí)候可以通過融合表達(dá)后切除的方法,得到不含F(xiàn)-Met的蛋白。 去掉該殘基盒不去掉該殘基引起蛋白性質(zhì)變化很大的情況有,但極少
首位的甲酰甲硫氨酸(fMet)在胞內(nèi)能被部分切除,切除的效率受第二位氨基酸側(cè)鏈的影響較大,不同序列切割率差異比較大。如果你是想要純化一些均一的不含fMet的目的蛋白做實(shí)驗(yàn),而不是用于大量生產(chǎn)的話,建議你在序列前面融合能完全切除的標(biāo)簽,比如在前面融合DDDDK,純化后用腸激酶切除,或者融合sumo標(biāo)簽,用ULP1切除,能得到均一的目的蛋白。
我們也出現(xiàn)這樣的問題,蛋白的甲硫氨酸去除不完全。有文獻(xiàn)報(bào)道可以使用氨肽酶處理純化后的蛋白,Aminopeptidase M處理人生長(zhǎng)激素(nakagawa1987)。
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你的導(dǎo)師。
細(xì)胞表達(dá)蛋白后,第一個(gè)氨基酸(F-Met)會(huì)被deformylase切除。
然鵝,如果表達(dá)量大,也有出現(xiàn)該殘基不會(huì)全被切除,這個(gè)時(shí)候可以通過融合表達(dá)后切除的方法,得到不含F(xiàn)-Met的蛋白。
去掉該殘基盒不去掉該殘基引起蛋白性質(zhì)變化很大的情況有,但極少
首位的甲酰甲硫氨酸(fMet)在胞內(nèi)能被部分切除,切除的效率受第二位氨基酸側(cè)鏈的影響較大,不同序列切割率差異比較大。如果你是想要純化一些均一的不含fMet的目的蛋白做實(shí)驗(yàn),而不是用于大量生產(chǎn)的話,建議你在序列前面融合能完全切除的標(biāo)簽,比如在前面融合DDDDK,純化后用腸激酶切除,或者融合sumo標(biāo)簽,用ULP1切除,能得到均一的目的蛋白。
請(qǐng)問您知道大量生產(chǎn)的話,一般用什么方法去除嗎?
我前面的表述可能有點(diǎn)問題。我本意是想說,如果你是在實(shí)驗(yàn)室里,需要幾十到幾百mg蛋白用于實(shí)驗(yàn)研究,那么直接重新構(gòu)建質(zhì)粒,在N端連上一個(gè)能完全去除的標(biāo)簽就行了,這樣簡(jiǎn)單、方便、高效。如果你是在藥企或其它單位,需要大量生產(chǎn)這個(gè)蛋白的話,那么需要考慮產(chǎn)量的問題。比如,在菌體表達(dá)蛋白總量相當(dāng)?shù)那闆r下,融合標(biāo)簽越長(zhǎng),目的蛋白占總蛋白比例就越少,所以產(chǎn)量就越少,而如果你的目的蛋白分子量本身就很小,那影響會(huì)更明顯。再比如,序列發(fā)生變化,表達(dá)量也會(huì)變化,極端(且常見)情況下甚至不表達(dá)。所以如果是生產(chǎn)的情況,建議你嘗試構(gòu)建多種不同的標(biāo)簽,根據(jù)實(shí)際表達(dá)來定奪(需要考慮融合蛋白的表達(dá)總量,蛋白結(jié)構(gòu)/活性的變化,副產(chǎn)物對(duì)后續(xù)工藝的影響等等,比較麻煩)。我前面語境好像在說融合標(biāo)簽不適合生產(chǎn),其實(shí)融合在生物制藥生產(chǎn)中是很常見的,這其實(shí)只是我表述有問題。其它能夠徹底、均一地切除fMet并且不對(duì)目的蛋白結(jié)構(gòu)造成影響的方法,目前我不太清楚
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謝謝!
我們也出現(xiàn)這樣的問題,蛋白的甲硫氨酸去除不完全。有文獻(xiàn)報(bào)道可以使用氨肽酶處理純化后的蛋白,Aminopeptidase M處理人生長(zhǎng)激素(nakagawa1987)。