sgRNA設(shè)計(jì)請(qǐng)教
CRISPR新手。
已知 sgTelomere-GTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTA。 怎么設(shè)計(jì)完整的 sgRNA的完整序列?有沒(méi)有相關(guān)文獻(xiàn)?我只查到這個(gè)靶向序列,但PAM等是怎樣的呢?有沒(méi)有直接的文獻(xiàn)?
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已知 sgTelomere-GTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTA。 怎么設(shè)計(jì)完整的 sgRNA的完整序列?有沒(méi)有相關(guān)文獻(xiàn)?我只查到這個(gè)靶向序列,但PAM等是怎樣的呢?有沒(méi)有直接的文獻(xiàn)?
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
PAM位點(diǎn),就是NGG序列,N代表任何一種核苷酸,合成的gRNA不能包括NGG
引物設(shè)計(jì)方法取決于你用的載體質(zhì)粒
最常用的是張峰的plenti-crispr體系,克隆這個(gè)sgRNA質(zhì)粒對(duì)應(yīng)的載體設(shè)計(jì)請(qǐng)看以下鏈接的說(shuō)明書(shū):
https://media.addgene.org/data/p ... nt_B3xTwla0bkYD.pdf
試劑盒與質(zhì)粒合成合成出來(lái)的序列完全一致嗎? 試劑盒合成的序列也具有 S. pyogenes terminator序列嗎
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試劑盒與質(zhì)粒合成合成出來(lái)的序列完全一致嗎? 試劑盒合成的序列也具有 S. pyogenes terminator序列嗎?