QST2優(yōu)化三天了,還沒有結(jié)束,幫忙看下有沒有問題
優(yōu)化一個(gè)分子閉環(huán)到開環(huán)的過渡態(tài),第一次選擇使用qst2進(jìn)行優(yōu)化,三天了,還沒有跑完,我是應(yīng)該截取中間態(tài)來做opt=ts呢?還是繼續(xù)讓它跑著呢?
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優(yōu)化一個(gè)分子閉環(huán)到開環(huán)的過渡態(tài),第一次選擇使用qst2進(jìn)行優(yōu)化,三天了,還沒有跑完,我是應(yīng)該截取中間態(tài)來做opt=ts呢?還是繼續(xù)讓它跑著呢?
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
首先,你的計(jì)算只用到了一個(gè)核心。沒用多核心并行。那算幾天其實(shí)也就是算了幾十步優(yōu)化而已。 而且從優(yōu)化的整體趨勢(shì)來看 已經(jīng)偏離開環(huán)的過渡態(tài)很遠(yuǎn)了,說明 通過初始和末態(tài)結(jié)構(gòu),QST2暴力求坐標(biāo)差值的方法 并沒有給出一個(gè)合理的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致過渡態(tài)優(yōu)化不出來?梢宰约翰聜(gè)結(jié)構(gòu) 然后用OPT=TS 試試看。
做了勢(shì)能面掃描,從中間截取了過渡態(tài)出來重新做了opt=ts,結(jié)果還沒看到
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估計(jì)還是你初始結(jié)構(gòu)有問題,把要成環(huán)的2個(gè)原子固定在2A(或2.2A),優(yōu)化后直接用ts試試?