真誠求問:請問DNA加合物相對定量色譜質(zhì)譜上具體怎么計(jì)算?
真誠求問各位大佬,
DNA加合物定量方面的問題...
目前知道的有絕對定量和相對定量兩種方式。
絕對定量目前流行的方式是穩(wěn)定同位素稀釋法,即通過已知濃度的同位素內(nèi)標(biāo)標(biāo)樣去定復(fù)雜基質(zhì)中的加合物的絕對含量(其實(shí)具體的計(jì)算方法也是很懵圈)
相對定量有兩種說法,一是算,UV-Vis先測DNA的含量,然后計(jì)算大概有多少個(gè)正常核苷酸,然后通過外標(biāo)法或者內(nèi)標(biāo)法吧,計(jì)算百分比;二是說用LC-MS/MS直接測核苷的響應(yīng),算出百分比.....(是否是這樣也不清楚...)
小妹真的對這塊真的十分懵圈,實(shí)在是找不到同門問,畢業(yè)在即,痛苦萬分。
而且目前很大的困難是標(biāo)樣不全,要檢測4種加合物并且算它們之間的比值,目前只有2種標(biāo)樣,想了各種方法實(shí)在是能力有限;更別提同位素標(biāo)樣,完全沒有;化合物本身毒性很大,再去標(biāo)樣合成幾乎沒戲......
相對定量是說 我有核苷標(biāo)準(zhǔn)品,然后稱重溶解算濃度,逐級稀釋,用和待測加合物同樣的色譜方法,找母子離子,優(yōu)化它的MRM峰形保留時(shí)間,然后做它的工作曲線,然后之后再做實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,水解DNA成核苷,上質(zhì)譜看響應(yīng),通過工作曲線算出正常核苷的濃度嗎?一般來說都是說XX個(gè)加合物/xx個(gè)正常核苷,這個(gè) 個(gè)是怎么算出來的? 難道是通過阿佛加德羅常數(shù)嗎... 這樣豈不是誤差非常大?
以及方法學(xué)考察部分,標(biāo)樣不全,能做多少呢?還有可信度嗎?碩士畢業(yè)論文根本實(shí)驗(yàn)都做不全,沒法畢業(yè)也沒法出文章阿。
十分煎熬!
希望有一步步的類似于protocol的教導(dǎo),萬分感謝!
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自己頂一下,老師說我們做檢測的不需要相對定量,但絕對定量我又做不到,emmmm,
只能多給自己打氣,船到橋頭自然直,
默默難受會(huì)
小木蟲的賬號14年大學(xué)剛?cè)雽W(xué)沒多久就注冊了,還記得當(dāng)時(shí)是咨詢的剛來實(shí)驗(yàn)室的清華博士老師,到現(xiàn)在利用率也很低,但是當(dāng)時(shí)注冊的時(shí)候肯定還是滿懷激情的,物是人非阿!。
現(xiàn)在一心想離開化學(xué)的坑,熬過最后半年,接下來是工作還是讀博也是未知,總而言之,希望星光不負(fù)趕路人吧,
正常核苷在樣品中濃度大,標(biāo)準(zhǔn)品易得可以直接液相色譜紫外檢測,用外標(biāo)法就可以。核苷加和物在樣品濃度低可以用液質(zhì)聯(lián)用一般配合內(nèi)標(biāo),如果加和物標(biāo)準(zhǔn)品無法獲得只能自制,然后建立加和物的標(biāo)準(zhǔn)曲線用內(nèi)標(biāo)法檢測,獲得加和物核苷和正常核苷濃度就可以做比值了。