誠心請教:兩株菌的16S測序結(jié)果很相似,可以算是同一株菌嗎?謝謝!
分離了一些腸球菌,27F和1492R引物對擴(kuò)增測序后,發(fā)現(xiàn)它們的序列信息很相似,很多只在序列的首尾部分有一些不同堿基,請教一下它們會是同一株菌嗎?非常感謝!
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分離了一些腸球菌,27F和1492R引物對擴(kuò)增測序后,發(fā)現(xiàn)它們的序列信息很相似,很多只在序列的首尾部分有一些不同堿基,請教一下它們會是同一株菌嗎?非常感謝!
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
不是可以把序列拿去NCBI里比對
看你的實驗?zāi)康,單單只是做一個鑒定,NCBI中去比對就好了,看得分和相似性。如果要是論文中的一部分?jǐn)?shù)據(jù),還要建樹,還有其他的形態(tài)和生理生化鑒定。
已經(jīng)在NCBI里比對過了,大概可以確認(rèn)種屬,只是不知道我得到的那幾株菌,會不會其實是同一株?
其實主要問題不是鑒定種屬,而是想確認(rèn)一下,分離得到的那幾株菌,會不會其實是同一株?畢竟它們的16S序列很相似
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建議再做其他持家基因的序列擴(kuò)增和測序,更容易確定是否同意菌株。
16S一致度多高?可以做形態(tài)、生理生化指標(biāo)的一些分析