請教rescue experiment 統(tǒng)計學(xué)方法
最近做了x基因敲除的細(xì)胞系，然后在這個細(xì)胞系中瞬時表達(dá)GFP-x基因,同時檢測某表型是否回歸正常水平，也就是rescue experiment（不知道中文叫什么，援救實驗嗎？），現(xiàn)在在做顯著性分析，對統(tǒng)計方法產(chǎn)生了疑問。
我設(shè)計了三組實驗并對其表型進(jìn)行了定量
1，對照組細(xì)胞（無敲除）表達(dá)GFP，
2，x基因敲除細(xì)胞系表達(dá)GFP，
3，x基因敲除細(xì)胞系表達(dá)GFP-x基因
我需要對比三組數(shù)據(jù)的表型，即，檢驗第二組與第一組有是否顯著差異，第三組與第二組是否有顯著差異，以及第三組是否回歸到第一組的水平。
我應(yīng)該用哪種統(tǒng)計方法進(jìn)行顯著差異分析？
是否應(yīng)該將三組數(shù)據(jù)拆成兩兩一組，分別進(jìn)行mann whitney test（數(shù)據(jù)不符合正態(tài)分布），還是應(yīng)該選擇其他檢驗方法？
我也考慮了kruskal-wallis test和two-way ANOVA
kruskal-wallis的問題是，我的數(shù)據(jù)中，表型受兩種因素影響（細(xì)胞系和表達(dá)的基因），并非單因素分析
用two-way ANOVA的話，缺少了一組【對照組細(xì)胞表達(dá)GFP-x】的數(shù)據(jù)，無法進(jìn)行分析，而且我覺得這組數(shù)據(jù)對實驗結(jié)論沒有影響
不知道有沒有對統(tǒng)計學(xué)比較了解的或者做過此類實驗的人能幫忙解答一下我的問題。
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
"檢驗第二組與第一組有是否顯著差異，第三組與第二組是否有顯著差異，以及第三組是否回歸到第一組的水平"
就按照這個做三次t檢驗就好了，不用搞那么復(fù)雜
謝謝解答，因為金幣不夠所以沒能及時回復(fù)。。。
請問第一組與第三組比較也可以用t檢驗嗎？細(xì)胞系和表達(dá)的基因都不一樣。
第一組和第三組比較確實不夠嚴(yán)謹(jǐn)，這個得看審稿人對于數(shù)據(jù)的嚴(yán)謹(jǐn)性要求有多嚴(yán)格了。
如果對照組是一個敲除對照會好一些，也就是說對照組也轉(zhuǎn)了Cas9和一個不能針對任何基因的sgRNA。
當(dāng)然還有一種策略是用siRNA敲低，對照組轉(zhuǎn)一個不能針對任何基因的對照siRNA。這樣就保證了三組都用同一個細(xì)胞系。
謝謝您的回復(fù)。
siRNA的策略確實做了，但由于一些原因放棄了這個方法，所以在用Cas9做。
比較麻煩的是沒有時間再做對照細(xì)胞系了，所以想找一個合適的統(tǒng)計方法。
請問，不對比第一組和第三組，只對比第二組與第一組，和第二組與第三組的數(shù)據(jù)，如果都有顯著性差異是否能說明結(jié)論
，
有時候第一組和第三組不一定非要沒有顯著差異，只要趨勢上有回復(fù)都可以說partially rescue。當(dāng)然如果你要是強(qiáng)調(diào)fully rescue，那就必須比較第一組和第三組了。