OLEX2解析單晶丟失碳原子
在用OLEX2解析單晶時(shí),五元環(huán)上的碳上丟失了一個(gè)甲基,通過(guò)growing能夠得到完整晶體,解析出來(lái)也沒(méi)有A、B類(lèi)錯(cuò)誤,但是解析出來(lái)的分子放到Mercury里面顯示與N相連的甲基始終有6個(gè)H,怎么修改也無(wú)法去除掉,求助是growing的步驟出錯(cuò)了,還是有其他的解決辦法。
來(lái)個(gè)高手幫下忙
解析后的分子.png

無(wú)A、B類(lèi)錯(cuò)誤.png
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
檢查碳原子的占有率,應(yīng)當(dāng)是分子處于對(duì)稱(chēng)面上,這很正常,六個(gè)氫的碳應(yīng)當(dāng)占有率0.5
不用管,畫(huà)圖的時(shí)候刪掉一半H就行,或者在OLEX2慢慢旋轉(zhuǎn)H的位置,使之不對(duì)稱(chēng)。
在growing后得到的C原子和相鄰C編號(hào)相同,且打開(kāi)后還是顯示不出來(lái),但是結(jié)構(gòu)式又是對(duì)的,我把文件加上了,幫我看看吧
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