酶的保守序列會(huì)因?yàn)橥饨缒撤N因素發(fā)生改變嗎?
本人最近在探究一種酶,但是這酶和現(xiàn)一種已知酶,序列極其相似,但是保守序列出有些不同。想著,這兩個(gè)會(huì)不會(huì)就是同一個(gè)酶,而因?yàn)橥饨缒撤N因素,但是其保守序列改變。對(duì)生物不是很懂,望大佬指教!
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本人最近在探究一種酶,但是這酶和現(xiàn)一種已知酶,序列極其相似,但是保守序列出有些不同。想著,這兩個(gè)會(huì)不會(huì)就是同一個(gè)酶,而因?yàn)橥饨缒撤N因素,但是其保守序列改變。對(duì)生物不是很懂,望大佬指教!
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
說得太含糊了,不同到什么程度。已知的酶和你要研究的酶是homolog, ortholog還是paralog?
通過信息學(xué)的比對(duì),給未知基因或蛋白的功能研究提供參考,這是常用的思路,其實(shí)重要的是如何去驗(yàn)證你的猜想。
你目前在研究的酶已經(jīng)有很多研究文獻(xiàn)了么?保守序列是如何確定的(一般是同家族的蛋白有一部分序列高度穩(wěn)定)?與已知酶序列同源性有多高?等等
如果想驗(yàn)證兩個(gè)酶在進(jìn)化上是否有相關(guān)性,一方面可以通過信息學(xué)進(jìn)行比對(duì)分析建立進(jìn)化樹。另一方面可以從功能學(xué)方面去驗(yàn)證兩個(gè)酶是否有相似的功能。最后,也應(yīng)考慮不同酶的來源,宿主的生存環(huán)境,代謝途徑等等,來為你的猜想提供數(shù)據(jù)支持,從而驗(yàn)證猜想。
祝好!
你可以查閱一下已知酶的研究資料,了解一下已知酶從發(fā)現(xiàn)到功能研究的實(shí)驗(yàn)策略,比如酶蛋白是否可以異源表達(dá),使用原核系統(tǒng)還是真核系統(tǒng),酶蛋白的驗(yàn)證方法是什么,酶活力的測(cè)定方法有哪些等等。
研究宏基因組里篩選獲得的基因,你可以通過異源表達(dá)的方式將該基因克隆至合適宿主,通過對(duì)該未知酶的表達(dá)、功能驗(yàn)證(可參考已知酶的研究方法)來確定所謂的保守序列的變化,是否影響或改變了酶的功能及活性,從而給未知酶的研究提供一些數(shù)據(jù)
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