已經(jīng)有多種菌的16s序列，怎么確定種類，建進(jìn)化樹
有百多個(gè)序列，老師讓把它們建個(gè)進(jìn)化樹，這些能健在一個(gè)樹里嗎，需要怎么操作�。∏蟠罄兄更c(diǎn)迷津
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
我弄了一個(gè)文件把序列全都放進(jìn)去了，然后去blast跑，但是跑了三個(gè)小時(shí)還沒有出來，blast能同一時(shí)間比對多個(gè)數(shù)據(jù)嗎？
所有的序列是可以放在一起建樹的，比對的時(shí)間長短和序列個(gè)數(shù)和長度有關(guān)系，如果序列條數(shù)太多，可以分開比對后合并
那我看視頻是一個(gè)自己的序列，然后他選了十幾個(gè)比對的序列，做了一個(gè)樹，我這有一百多個(gè)自己的序列，到時(shí)候怎么選他對比的那個(gè)序列呢？
，
我那樣跑的結(jié)果是沒出來，是不是得單個(gè)的在blast比較，然后再自己把數(shù)據(jù)整合到一起再建樹
一百多個(gè)序列是有點(diǎn)多，你可以分批比對，比如每次只比對10-20個(gè)，最后匯總所有結(jié)果