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wuli8

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csfn(金幣+10,VIP+0):專帖主辛苦了，平安小紅包慰勞:-)

引用回帖:

Originally posted by lsllsllsl at 2008-12-7 11:24:
我昨天用IF9和MKL8編譯

大概也是你這個(gè)問(wèn)題。

用PGI編譯，只出現(xiàn)8個(gè)小的make clean問(wèn)題，

所以就用PGI了，

不知道有什么不好的影響。。。

你用的是什么操作系統(tǒng)？
謝謝！

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11樓2008-12-07 14:08:27

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lsllsllsl

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wuli8(金幣+2,VIP+0):感謝您的交流！(*^__^*) ……
wuchenwf(金幣+2,VIP+0):xiexie

Red Hat Enterprise Linux 5.0

我也是幫別人裝WIEN2K

以前從來(lái)沒(méi)用過(guò)

所以，也不知道怎樣測(cè)試，呵呵

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12樓2008-12-07 17:07:38

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wax54

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wuli8(金幣+1,VIP+0):新帖開張，提問(wèn)有獎(jiǎng)！(*^__^*) 嘻嘻……

ｇｈｏｓｔｂａｎｄｓ都去掉了，為什么還不能繼續(xù)算下去呢？

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13樓2008-12-07 21:12:27

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wuli8

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wax54  發(fā)的編譯過(guò)程：

應(yīng)管理員的要求，我準(zhǔn)備把wien2k在amd架構(gòu)服務(wù)器上整個(gè)的編譯過(guò)程與大家分享。希望可以對(duì)初接觸wien的蟲友一些幫助。在下其實(shí)也剛剛接觸，能力有限，錯(cuò)誤之處還望各位多多指正。另外，由于本人對(duì)wien2k的程序還不熟悉，也希望就計(jì)算過(guò)程中出現(xiàn)的問(wèn)題與大家多多交流。
1、系統(tǒng)的安裝
因?yàn)橐梅⻊?wù)器搭建一個(gè)簡(jiǎn)單的集群，為了參考車靜光老師的《微機(jī)集群組建、優(yōu)化和管理》，所以決定選用suse linux。我用的是enterprise sever x86-64版。設(shè)置需要安裝軟件的時(shí)候，即使全部選中也還有很多的package沒(méi)有安裝。這時(shí)，可以按detail鍵，選擇package group在其中查找gunplot，將其選中，否這運(yùn)行wien2k的時(shí)候無(wú)法顯示態(tài)密度圖。
2、編譯器的安裝
我選擇了pgi的編譯器7.0所謂的tbe版，不知道是不是破解版，還沒(méi)有過(guò)15天。安裝起來(lái)比較容易，將過(guò)程略去。
3、Mpich2的安裝
安裝之前執(zhí)行export FC=pgf90 CC=pgcc FFLAGS="-mcmodel=medium" CFLAGS=="-mcmodel=medium" CCFLAGS=="-mcmodel=medium" RSHCOMMAND=rsh
mkdir /where_you_install_mpich2
./configure -prefix=/where_you_install_mpich2
make
make install
PS：安裝結(jié)束別忘記聲明
4、數(shù)學(xué)庫(kù)的安裝
   數(shù)學(xué)庫(kù)的選擇頗為麻煩。聽(tīng)說(shuō)對(duì)于amd的平臺(tái)，pgi+libgoto運(yùn)算最快。對(duì)數(shù)學(xué)庫(kù)不熟悉的我最初嘗試了用intel的ifort，icc和intel的mkl。我發(fā)現(xiàn)mkl的設(shè)置非常麻煩，尤其9和10架構(gòu)有較大的差異，導(dǎo)致很難編譯成功（盡管我參考了那篇著名的《Compiling Wien2k on Intel based systems with Suse Linux》）。按照Fecher的建議，我選擇了mkl9，但是設(shè)置并行的時(shí)候還需要自己從網(wǎng)上下載blacs，scalapack等等，編譯起來(lái)非常麻煩，極有可能設(shè)置錯(cuò)誤。mkl10包含了scalapack,但是userguide對(duì)結(jié)構(gòu)的介紹讓人頭疼。后來(lái)參考了一位網(wǎng)友編譯的例子（對(duì)不起，現(xiàn)在找不到那篇帖子了，無(wú)法指名出處），感覺(jué)編譯過(guò)程中參數(shù)設(shè)置非常奇怪，即使編譯通過(guò)，運(yùn)算過(guò)程還是出現(xiàn)錯(cuò)誤。后來(lái)我發(fā)現(xiàn)了張挺的一篇關(guān)于上海超級(jí)計(jì)算中心編譯wien2k的文章，按照上面的介紹，我選擇了amd的核心數(shù)學(xué)庫(kù)acml3.1，不過(guò)為了方便并減少可能出錯(cuò)的環(huán)節(jié)，我選擇了amdscalapck3.1。這兩個(gè)數(shù)學(xué)庫(kù)安裝起來(lái)相當(dāng)容易，沒(méi)有了繁瑣的makefile的設(shè)置過(guò)程，只要install就可以了。
5、編譯過(guò)程
   gunzip *.gz
   chmod +X ./expand_lapw
./expand_lapw (由于這三個(gè)過(guò)程都非常容易，略過(guò))
下面我重點(diǎn)說(shuō)下./siteconfig_lapw
系統(tǒng)的選擇：選擇L (linux+pgi )
接下來(lái)的設(shè)置非常容易，基本選擇默認(rèn)的設(shè)置就可以。需要指出的是，在設(shè)置LDFLAGS時(shí)，最好給出絕對(duì)路徑。我試了幾次沒(méi)有給出決定路徑，總是提示找不到blas或者lapack。
接下來(lái)是并行過(guò)程的設(shè)置。如果蟲友的計(jì)算環(huán)境是單臺(tái)多cpu的工作站或者服務(wù)器，shared memory一項(xiàng)選擇y，接下來(lái)選擇y和mpif90。如果為集群，可以選擇n，rsh，y和mpif90。
下面最重要的RP_LIBS的設(shè)置。我起初按照張挺文章上的設(shè)置，編譯過(guò)程總是抱錯(cuò)。我后來(lái)在compile message中發(fā)現(xiàn)出錯(cuò)可能和RP_LIBS中設(shè)置的順序有關(guān)（只是感覺(jué)，不知是否正確）。以下是我的具體參數(shù)設(shè)置（我將數(shù)學(xué)庫(kù)和編譯起都安裝在了/opt目錄中）：  /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libscalapack.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libacml.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacsF77init.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacsCinit.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacs.a
6、編譯
   選擇編譯全部的程序，編譯過(guò)程可能持續(xù)10幾分鐘。
結(jié)語(yǔ)
按照上述編譯過(guò)程我在集群上試驗(yàn)了TiC的例子，計(jì)算成功。然而對(duì)于LaSrMnO的例子在計(jì)算至lapw2時(shí)候始終失敗，可能是我對(duì)程序不夠熟悉，部分參數(shù)設(shè)置有誤吧。計(jì)算過(guò)程中我一直選擇的是k點(diǎn)并行，因?yàn)槲业募褐挥?0個(gè)核心。mpi并行不知道是否設(shè)置成功，歡迎大家多多提供信息。

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14樓2008-12-08 10:15:16

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求助的問(wèn)題2：
求：Wien2k 8.3
謝謝

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-21 at 09:56 ]

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15樓2008-12-08 10:56:48

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問(wèn)：

引用回帖:

【求助】：如何安裝wien2k，wien2k好用嗎

如何安裝wien2k

答：

引用回帖:

我在red hat 9.0和redhat enterprise 5下安裝成功，不過(guò)先要設(shè)置好intel編譯器的位置和使用權(quán)限：
[user@Linux wien]$ tar -xvf WIEN2k.tar
[user@Linux wien]$ gunzip *.gz
[user@Linux wien]$ chmod +x ./expand_lapw
[user@Linux wien]$ ./expand_lapw
[user@Linux wien]$ ./siteconfig
[user@Linux wien]$ w2web

問(wèn)：

引用回帖:

請(qǐng)?jiān)敿?xì)講一下如何設(shè)置好intel編譯器的位置和使用權(quán)限？
謝謝�。�

答：

引用回帖:

我是這樣做的，如果你是管理員，直接就將ifort的命令放到/bin目錄下，那么就可以將ifort做為一個(gè)命令，其他用戶都可以使用。如果是一般用戶那得設(shè)置ifort的路徑了，不然linux找不到。假設(shè)你是bash用戶，那就可以修改你的.bash_profile，在里面加一句
source 安裝路徑/ifortvars.sh
那么下次登陸的時(shí)候，就可以直接運(yùn)行ifort了。不放心就編一個(gè)簡(jiǎn)單的fortran程序，測(cè)試一下就行了

引用回帖:

下面是一個(gè)簡(jiǎn)單的測(cè)試程序
program first
print *, "Hello World!"
end program first
編好后比如命名為first。f90
然后ifort first.f90 就會(huì)生成a.out
然后運(yùn)行./a.out，當(dāng)然你也可以生成指定的文件名例如
ifort -o first first.f90
運(yùn)行之后文件名就是first了運(yùn)行./first就可以了。
運(yùn)行程序后如果顯示Hello World!那就說(shuō)明安裝成功了

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:43 ]

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16樓2008-12-08 13:35:39

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問(wèn)：

引用回帖:

【求助】在wien2k這個(gè)軟件這個(gè)軟件中如何修改芯電子和價(jià)電子

在wien2k這個(gè)軟件這個(gè)軟件中如何修改芯電子和價(jià)電子
在初始化的過(guò)程中的那個(gè)步驟？
修改那個(gè)文件？
如何修改那些文件？
知道的告訴一下
謝謝

答：

引用回帖:

inc是芯電子，in2是價(jià)電子吧

這個(gè)是正解，要去掉一個(gè)芯電子就將里面的數(shù)字修改一下就可以，但是你要確定該的是s還是p的。然后在in2中相應(yīng)的將價(jià)電子數(shù)增加一下就可以了

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:43 ]

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17樓2008-12-08 13:52:41

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【求助】如何實(shí)現(xiàn) wien2k lapw0并行計(jì)算
對(duì) lapw0 的編譯通過(guò)

按照說(shuō)明寫入 lapw0 的 .machines 文件

直接 runsp_lapw -p ******* 運(yùn)行提示 no match 錯(cuò)誤

望高手指教

引用回帖:

在利用k點(diǎn)并行計(jì)算的時(shí)候
lapw0是不能并行的
但是lapw1和lapw2是可以并行的

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:42 ]

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18樓2008-12-08 13:55:41

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【求助】如何畫能帶圖

wien2k下哪個(gè)文件是用來(lái)畫能帶圖的，如何將其導(dǎo)入到oginin里面畫圖

答：

引用回帖:

*.spaghettidn_ene
*.spaghettidn_ene
這兩個(gè)文件是保存著用來(lái)畫能帶圖的數(shù)據(jù)
在origin里打開
利用最后的兩列
分別作為橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)
就可以畫出能帶圖了

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:42 ]

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19樓2008-12-08 13:57:13

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[求助]SUSE下安裝wien2k

zt970831(金幣+0,VIP+0):發(fā)帖后請(qǐng)您到置頂目錄帖按照格式登記，有獎(jiǎng)勵(lì)，謝謝�。海�

SUSE下安裝wien2k， intel fortran 10.0和mkl10.0都安裝好了，但編譯的時(shí)候有很多錯(cuò)誤，我覺(jué)得可能是linking or library 設(shè)置得不對(duì)，有沒(méi)有哪位高手給詳細(xì)指點(diǎn)一下該怎么設(shè)置，本人新手，對(duì)linux還不熟悉。

答：

引用回帖:

fortran 和mkl裝好了還不行的，你要把他們的路徑加進(jìn)去才行。具體怎么加附件里有詳細(xì)的說(shuō)明，你看看吧，我也是網(wǎng)上看到的，希望有所幫助。http://www.gaoyang168.com/bbs/attachment.php?aid=405864&checkid=d8cc7&download=1

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20樓2008-12-08 13:59:36

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