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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
這個不難：關于sof和XYZ前面的已經說了，我就不說了在這里。
晶胞中原子的坐標有兩種表示方法，一種fractional，一種measured實際上一般都會使用fractional坐標（分數(shù)坐標，（0.5，0.5，0.5）表示在晶胞的
中心位置有原子，（0.5，0.5，0）表示在xy面心有原子，一次類推）。
site的地方可以選擇坐標的格式。measure一般是原子的實際迪卡爾坐標。相對于原點的。在晶胞建模的時候一般不采用。
attached的意思是當兩個原子的距離小于某一值是合為一個原子。
position的解釋可能有些麻煩，這個晶體學中說的wickoff position，一般有，按晶胞對稱性的差別一般是以a,b,c,d,e,f……表示的，這個表示晶胞中的一些特殊對稱位置，比如四面體中心，八面體中心等等。字母前面的數(shù)字表示這樣的位置在晶胞單胞中的數(shù)目，比如4a表示a位置在單胞中有4個。
要想建立一個晶胞需要以下步驟：
1 晶胞的空間群
2 晶胞各原子的坐標
這兩個都具備了就可以用dimond模擬晶胞了。
另外還有一個更簡單的方法，就是直接獲得晶體的cif數(shù)據(jù)，導入dimond就可以了。cif數(shù)據(jù)的獲取可以在線也可以用軟件Findit 2008，網上有下的下載安裝就可以。在線的數(shù)據(jù)庫有COD：
http://www.crystallography.net/ |
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