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前田慶次

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10樓: Originally posted by gump_813 at 2013-12-03 00:37:18
http://theory.cm.utexas.edu/bader/vasp.php
不知道你是不是按照鏈接里的步驟做的？可能是原子volume的劃分有問題。你照這個做一下試試把

確實是按照這個上面來的，先合并，再分析，怎么聽有的人說要編譯？我是直接下了就用的，但是這三個怎么會出現(xiàn)這樣的結(jié)果，實在是讓人郁悶，請大俠指教

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11樓2013-12-03 09:03:43

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gump_813

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11樓: Originally posted by 前田慶次 at 2013-12-03 09:03:43
確實是按照這個上面來的，先合并，再分析，怎么聽有的人說要編譯？我是直接下了就用的，但是這三個怎么會出現(xiàn)這樣的結(jié)果，實在是讓人郁悶，請大俠指教...

如果計算沒錯誤的話（感覺應(yīng)該沒問題）可能是網(wǎng)格不夠密吧 NGX NGY NGZ 多一點試試
這個能肯定解決電子數(shù)加起來不等于總電子數(shù)的問題

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12樓2013-12-03 09:34:45

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12樓: Originally posted by gump_813 at 2013-12-03 09:34:45
如果計算沒錯誤的話（感覺應(yīng)該沒問題）可能是網(wǎng)格不夠密吧 NGX NGY NGZ 多一點試試
這個能肯定解決電子數(shù)加起來不等于總電子數(shù)的問題...

好的，前輩，我試試網(wǎng)格加密一下，多謝指導(dǎo)

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13樓2013-12-03 09:38:20

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lfhuang

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只能說：珍愛生命，遠離bader analysis，尤其是共價和金屬體系。

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先進使役材料計算（https://aidme.nimte.ac.cn）

14樓2013-12-03 23:57:24

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14樓: Originally posted by lfhuang at 2013-12-03 23:57:24
只能說：珍愛生命，遠離bader analysis，尤其是共價和金屬體系。

不知道有什麼好辦法?矸治鯖姾賒D移量，請大俠指教

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15樓2013-12-04 00:20:11

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lfhuang

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

引用回帖:

15樓: Originally posted by 前田慶次 at 2013-12-04 00:20:11
不知道有什麼好辦法?矸治鯖姾賒D移量，請大俠指教...

Mulliken, or Löwdin population
這兩者用的都是自然的原子軌道，不像Bader，太artificial了，很多結(jié)果太出乎物理之外了，雖然數(shù)學(xué)上看貌似挺漂亮的。

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16樓2013-12-04 20:18:38

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引用回帖:

16樓: Originally posted by lfhuang at 2013-12-04 20:18:38
Mulliken, or Löwdin population
這兩者用的都是自然的原子軌道，不像Bader，太artificial了，很多結(jié)果太出乎物理之外了，雖然數(shù)學(xué)上看貌似挺漂亮的。...

不好意思，大俠，我是vasp，好像做不了Lowdin，能做Mullken嗎？應(yīng)該如何做呢？小木蟲上看了一圈沒找到，請指教

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17樓2013-12-04 21:04:15

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jpchou

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【答案】應(yīng)助回帖

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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??????Y???е???????
1)
#          X             Y             Z          CHARGE    MIN DIST ATOMIC VOL
--------------------------------------------------------------------------------
1    2.8516    0.0000    14.9709    5.8719    0.6070    23.5489

????N?? graphene ?е? carbon CHARGE ???? 6 ?????
?@?????????r????? 6 ?? carbon pseudopotential ??????
??????????????? carbon pseudopotential
??? LDA ?е? C_f_AE ??? carbon ???????????
??????????????
??????LDA?? C_f_AE ?@?? potential ???
????N????@?N??? pseudopotential??
?@?? potential ??????????? f ?????????????? GW ???
????N???????????c?? pseudopotential ?????????

2) ??????}???F?? Sn_d
??? Sn_d ??R???? 4 electrons(Sn)????????? 14 electrons (Sn_d)
???????s?? 48, 77, 57 ?@??????????
??_?? pseudopotential ?????????N?????_??????????

3) ?????? bader ????~ ??????????????? ????ε????? Sn ?? graphene top site
#       X          Y          Z       CHARGE    MIN DIST ATOMIC VOL
--------------------------------------------------------------------------------
1    0.0000    1.4321    0.0716    4.2822    0.5444    19.8883
2    -1.2312    3.5536    0.0097    4.1862    0.5341    29.2822
3    -2.4605    5.6828    0.0097    4.0437    0.5341    27.5840
4    -3.6822    7.8098    0.0716    4.0419    0.5444    19.5622
5    1.2312    3.5536    0.0097    4.1862    0.5341    29.2831
6    0.0000    5.6839    0.0046    3.5521    0.5329    35.0840
7    -1.2293    7.8153    0.0097    4.1810    0.6237    28.3925
8    -2.4571    9.9492    0.0104    3.9786    0.5353    24.8910
9    2.4605    5.6828    0.0097    4.0437    0.5341    27.5840
10    1.2293    7.8153    0.0097    4.1810    0.6237    28.3328
11    0.0000    9.9456    0.0358    3.5548    0.5328    31.6900
12    -1.2317    12.0789    0.0358    3.8292    0.5328    32.0760
13    3.6822    7.8098    0.0716    4.0419    0.5444    19.5622
14    2.4571    9.9492    0.0104    3.9786    0.5353    24.8910
15    1.2317    12.0789    0.0358    3.8292    0.5328    32.0760
16    0.0000    14.2051    0.0104    4.3248    0.6002    24.8133
17    0.0000    0.0000    0.0904    4.5284    0.6238    20.6944
18    3.6865    10.6633    0.0143    4.0505    0.5407    24.3197
19    2.4595    12.7878    0.0249    3.9629    0.5344    32.2835
20    1.2331    14.9126    0.0143    3.9993    0.5407    24.2233
21    -3.6865    10.6633    0.0143    4.0505    0.5407    24.2822
22    0.0000    4.2637    0.0035    3.7685    0.5333    28.9219
23    -1.2299    6.3940    0.0035    3.9575    0.5333    29.7732
24    -2.4533    8.5275    0.0143    4.1287    0.5503    24.3274
25    -2.4595    12.7878    0.0249    3.9629    0.5344    32.2835
26    1.2299    6.3940    0.0035    3.9575    0.5333    29.7749
27    0.0000    8.5278    0.0249    3.7627    0.5344    31.0428
28    -1.2304    10.6574    0.0357    3.8921    0.5340    28.7674
29    -1.2331    14.9126    0.0143    3.9993    0.5407    24.1114
30    2.4533    8.5275    0.0143    4.1287    0.5503    24.3274
31    1.2304    10.6574    0.0357    3.8921    0.5340    28.7648
32    0.0000    12.7886    0.0357    4.1297    0.5342    30.1506
33    0.0000    0.0000    2.6194    13.5934    1.2132 385.9883
--------------------------------------------------------------------------------
VACUUM CHARGE:             0.0000
VACUUM VOLUME:             0.0000
NUMBER OF ELECTRONS:    142.0000

????????
?????????? valence electron=4 ??????
????CHARGE?????? 4 ????
???????????????Y???c???Y?? (T)
Sn ????c graphene ???x?s 2 A
?@?]????}
???????Y??~?Y????~ Sn ??λ??????
T 33    7.1303    0.0000    2.7788
B 33    7.4868    -0.6175    2.7575 (?? z ???? B ???? T ????????棬???^???????в? 0.03A ????~???????С??Щ~??????????)
H 33    8.5563    0.0000    3.1380 (?@?????x?V??Sn ????c graphene ?x?_ 3A ????)

H ??Y???@? Sn ?????????? graphene ?? hollow site
(Sn ?x graphene ?@?N?h~?]?Y??????????????)
?@??c?????īI??????????

3) ?????????^????????
??Sn?cgraphene ?g???x???v
??????Y???]?e~???????? E(T)~E(B) > E(H)
????????????????

??_?J??????????(POSCAR, POTCAR, INCAR, KPOINTS)??????_
?????N????~???_?J

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18樓2013-12-05 05:43:10

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???????:

18?: Originally posted by jpchou at 2013-12-05 05:43:10
??????Y???е???????
1)
# X Y Z CHARGE MIN DIST ATOMIC VOL
-------------------------------------------------------------------------------- ...

(1) ???????????W?????pseudopotential???]???x????????@??????POTCAR?Y???@????@??00????????????@???汾??C?I?????????r?????4?????????????????N????6????
(2) Sn?I???????????r????@????14??
(3) ??????_????????

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19樓2013-12-05 10:26:26

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引用回帖:

我遇到volume劃分的問題，請問增加NGX，NGY，NGZ就可以解決了嗎？

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20樓2016-05-25 14:45:25

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