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Gloriazpp

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你好，請(qǐng)問(wèn)一下，我想分析我的蛋白分子內(nèi)的氫鍵變化情況，在選擇組分的時(shí)候是都選“protein”嗎？

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回復(fù)此樓

11樓2018-12-28 15:03:17

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lao7

金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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引用回帖:

8樓: Originally posted by jiazhuamh at 2014-06-15 12:45:21
在Gromacs中判斷氫鍵要滿(mǎn)足兩個(gè)條件，距離和角度，g_hbond統(tǒng)計(jì)了滿(mǎn)足距離限制（<0.35A)的所有原子對(duì)，如果這些原子對(duì)也同時(shí)滿(mǎn)足角度限制（也就是可以判定為氫鍵）就放入第二列；其余的僅滿(mǎn)足距離限制，不滿(mǎn)足 ...

回復(fù)的很好！謝謝，一般選擇第二列，即滿(mǎn)足距離和角度限制的雙重條件。

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回復(fù)此樓

12樓2020-01-02 10:11:10

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