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lm_nudt

鐵桿木蟲 (著名寫手)

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專業(yè): 爆炸與沖擊動(dòng)力學(xué)

再推薦兩個(gè)

1、也是老漢的！
【名稱】Accelrys公司推出免費(fèi)的Discovery Studio Visualizer
【鏈接】http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=247121&fpage=21
2、計(jì)算器也算是軟件吧
【名稱】網(wǎng)絡(luò)化學(xué)計(jì)算器大集
【鏈接】http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=283606&fpage=21

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21樓2008-06-22 15:42:21

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liverangel

木蟲 (著名寫手)

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★ ★ ★
csfn(金幣+3,VIP+0):3q

數(shù)值計(jì)算（可以執(zhí)行大部分matlab功能）octave
以及其出圖軟件(gnuplot) www.gnuplot.info

強(qiáng)大啊，
支持腳本文件
同時(shí)擁有l(wèi)inux版本和windows版本

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在明天到來之前不要放棄，想想你今天能干些什么？

22樓2008-06-24 11:03:12

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狼狼乾坤

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轉(zhuǎn)帖的abinit簡介

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金幣+5,VIP+0):3q

ABINIT
簡介：ABINIT的主程序使用贗勢和平面波，用密度泛函理論計(jì)算總能量，電荷密度，分子和周期性固體的電子結(jié)構(gòu)，進(jìn)行幾何優(yōu)化和分子動(dòng)力學(xué)模擬，用TDDFT（對(duì)分子）或GW近似（多體微擾理論）計(jì)算激發(fā)態(tài)。此外還提供了大量的工具程序。程序的基組庫包括了元素周期表1-109號(hào)所有元素。ABINIT適于固體物理，材料科學(xué)，化學(xué)和材料工程的研究，包括固體，分子，材料的表面，以及界面，如導(dǎo)體、半導(dǎo)體、絕緣體和金屬。

功能：
可以計(jì)算很多物理屬性：
A. 計(jì)算倒格子中核與電子的總能量。
A.1. 計(jì)算使用平面波和贗勢。
A.2. 總能量的計(jì)算使用密度泛函理論（DFT）�？梢允褂么蠖鄶�(shù)重要的局域密度近似 (LDA)，包括Perdew-Zunger近似�？梢允褂脙煞N不同的局域自旋密度(LSD)，包括Perdew Wang 92和M. Teter的LSD。還可以使用Perdew-Burke-Ernzerhof，revPBE，RPBE和HCTH等GGA (自旋極化和非極化)。
A.3. 自恰場計(jì)算生成DFT基態(tài)，以及相關(guān)的能量和密度。此后的非自恰計(jì)算可以對(duì)能帶結(jié)構(gòu)的大量k-點(diǎn)產(chǎn)生本征能量。態(tài)密度的計(jì)算即可以用四面體方法，也可以用模糊技術(shù)。
A.4. 程序可以使用多種不同的贗勢。對(duì)整個(gè)周期表適用的有兩種：Troullier-Martins型和Goedecker型（這種類型包括自旋-軌道耦合）。如果需要的話，有四個(gè)代碼可以產(chǎn)生新的贗勢。
A.5. 程序本身可以處理金屬和絕緣體系。
A.6. 晶胞可以是正交或者非正交。計(jì)算可以輸入任何對(duì)稱性及相應(yīng)的k-點(diǎn)集。
A.7. 電子體系可以用自旋極化和自旋非極化計(jì)算。一個(gè)特殊的選項(xiàng)可以有效地處理反鐵磁性�？梢詫�(duì)總能量計(jì)算非共線的磁性（不能用于力，張量，相應(yīng)函數(shù)...）。可以禁止晶胞的總磁矩。
A.8. 總能量，力，張量和電子結(jié)構(gòu)的計(jì)算可以考慮自旋-軌道耦合。
A.9. 能量可分解為不同的成分（局域勢，XC，Hartree...）。
A.10. 計(jì)算內(nèi)部電子本征值。
A.11. 230個(gè)空間群和1191個(gè)Shubnikov磁群的對(duì)稱性分析。
B. 計(jì)算總能量和本征能量
B.1. 用解析公式計(jì)算Hellman-Feynman力。
B.2. 計(jì)算應(yīng)力。
B.3. 極化的計(jì)算。
B.4. 響應(yīng)的計(jì)算。
B.5. 計(jì)算近似的和準(zhǔn)確的磁化系數(shù)矩陣和介電矩陣。
B.6. 解析計(jì)算電子本征能量的導(dǎo)數(shù)。
B.7. 計(jì)算光學(xué)傳導(dǎo)性。
B.8. Born有效電荷的能帶分解，以及局域化張量的計(jì)算。
C. 激發(fā)態(tài)
C.1. 用GW近似計(jì)算電離能和親和能。
C.2. 用TDDFT計(jì)算原子和分子的（單重、三重）激發(fā)態(tài)和振蕩強(qiáng)度。
D. 移動(dòng)原子，改變晶胞參數(shù)
D.1. 用不同的方法尋找平衡構(gòu)型�？梢酝瑫r(shí)優(yōu)化晶胞參數(shù)。優(yōu)化過程中如果需要的話，可以固定指定的晶胞參數(shù)，角度，或原子位置。
D.2. 有兩種算法進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算。
D.3. 自動(dòng)分析鍵長鍵角。原子坐標(biāo)的格式支持用可視化軟件XMOL顯示。
E. 分析和圖形工具
E.1. 后期處理程序cut3d用于分析密度和勢文件。它還可以改變文件格式，提取2D明面或者1D線。此外還可以分析波函文件。
E.2. 另一個(gè)后期處理程序aim，用于進(jìn)行Bader的“原子中的分子”（AIM）密度分析。
E.3. 對(duì)可視化程序產(chǎn)生格式化數(shù)據(jù)：鍵結(jié)構(gòu)（用XMGR顯示），不同參數(shù)的總能量（用XMGR顯示），電荷密度（3D輪廓線，先用cut3d，再用商業(yè)程序matlab；cut3d也可以產(chǎn)生2D密度圖）。
E.4. 后期處理程序band2eps自動(dòng)畫出eps格式的聲子散射曲線。

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23樓2008-07-01 08:16:10

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狼狼乾坤

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菜鳥安裝abinit的經(jīng)歷~~（娛樂用）

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金幣+5,VIP+0):hehe，把你的安裝補(bǔ)充完整呀 :-)

1、使用ubuntu系統(tǒng)，上來就裝abinit，缺少n多東西，于是安裝g95、blas、fftw、lapack等，安裝g95時(shí)有出錯(cuò)提示：缺少C編譯器。
2、于是裝gcc，也安裝不上，后經(jīng)高人指點(diǎn)，安裝完整版linux，使用鏡像文件自帶的gcc等，還自帶了blas,lapack,fftw等。
3、安裝好上述程序，開始安裝abinit，是從debian的官網(wǎng)上下的，安裝到make步驟的時(shí)候出錯(cuò)：tar:找不到一個(gè)路徑下的lapack_pre_abinit3.2一類的提示，以為是lapack的原因，于是下載lapack安裝，又出錯(cuò)，錯(cuò)誤信息127，很多人有同樣的錯(cuò)誤，沒解決。
4、再仔細(xì)看了下安裝abinit時(shí)的出錯(cuò)信息，按提示找不到文件的路徑查看了下，果然文件夾是空的（~~~�。。�
5、從別處下載了abinit，解壓后先看了上述路徑，存在那個(gè)文件，于是安裝這個(gè)abinit，安裝成功。
6、從任意目錄下輸入abinis，提示說沒有這個(gè)命令，郁悶，難道我沒安裝成功嗎？
7、學(xué)習(xí)abinit官網(wǎng)上的tutorial1，人家說我這個(gè)安裝情況要在abinit/src/main目錄下輸入abinis才好使，于是試了下，終于可以了……

雖然安裝了，但是還有N多問題沒解決，菜鳥還是一頭霧水的，希望有大蝦看到給予解答~~以下是未解決的問題：
1、linux掛載不上移動(dòng)硬盤，插上移動(dòng)硬盤后，掛載不上，盤還有“噠噠”的聲音
2、為什么debian官網(wǎng)上下的abinit卻少東西，安裝出問題，是否我少下了什么東西？
3、安裝lapck時(shí)有出錯(cuò)信息127
4、abinit的安裝步驟：
./config/scripts/makemake
./configure
make
make install
是否我的安裝步驟太簡單了？所以不能在任意目錄下運(yùn)行abinit？只能在~/src/main下運(yùn)行？

[ Last edited by 狼狼乾坤 on 2008-7-1 at 08:47 ]

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24樓2008-07-01 08:43:32

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zxzj05

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我覺得abinit、pwscf是不錯(cuò)的免費(fèi)軟件，二者均可以用于聲子譜計(jì)算，
另外二者也各有別的功能。

abinit包含了GW近似計(jì)算，可以有效解決激發(fā)態(tài)、半導(dǎo)體能隙問題；
http://www.abinit.org/

pwscf可以計(jì)算強(qiáng)關(guān)聯(lián)系數(shù)U、CPMD第一性原理分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算，并且將從頭算分子動(dòng)力學(xué)從中區(qū)分開。
http://www.pwscf.org/

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儲(chǔ)氫家族歡迎儲(chǔ)氫研究者！

25樓2008-07-09 14:03:39

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百合588

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看看先，

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26樓2008-07-15 09:06:29

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njiview

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CPMD也是免費(fèi)的

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27樓2008-07-16 22:21:41

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cxl1379

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推薦hyperchm gaussian98或03 GaussView chemoffice這幾款畫圖或計(jì)算軟件

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28樓2008-07-24 09:03:52

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匿名

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29樓2008-07-26 08:22:03

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zsma

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是不是整理活動(dòng)已經(jīng)結(jié)束了啊，本來想毛遂自薦的，下次吧。

祝貴版越辦越好

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絕沒說是第一，更沒有說是第二！

30樓2008-07-28 13:42:19

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