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欣晴5832

金蟲(chóng) (小有名氣)

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[交流] 【求助/交流】有哪位知道系統(tǒng)發(fā)育研究中測(cè)定物種GC含量的意義呀？

如題，期待高手指教！

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1樓 2011-02-27 22:10:24

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cdl007

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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西瓜(金幣+5, EPI+1): 很好很強(qiáng)大，繼續(xù)發(fā)揚(yáng)哦！ 2011-05-26 22:06:29

Goodfellow 和 O'Donnell(1993) 提出 DNA 的 G+C mol% 差異≤ 10 ％ ~12 ％及 16S rDNA 的序列同源性≥ 95 ％的種可歸為同一屬。

每一個(gè)微生物種的 DNA 中 GC mol% 的數(shù)值是恒定的，不會(huì)隨著環(huán)境條件、培養(yǎng)條件等的變化而變化，而且在同一個(gè)屬不同種之間， DNA 中 GCmol% 的數(shù)值不會(huì)差異太大，可以某個(gè)數(shù)值為中心成簇分布，顯示同屬微生物種的 GC mol% 范圍。 DNA 中 GC mol% 分析主要用于區(qū)分細(xì)菌的屬和種，因?yàn)榧?xì)菌 DNA 中 GC 含量的變化范圍一般在 25 ％～ 75 ％；而放線菌 DNA 中的 GC 比例范圍非常窄 (37 ％～ 51%) 。一般認(rèn)為任何兩種微生物在 GC 含量上的差別超過(guò)了 10 ％，這兩種微生物就肯定不是同一個(gè)種。因此可利用 G+C mol ％來(lái)鑒別各種微生物種屬間的親緣關(guān)系及其遠(yuǎn)近程度。值得注意的是，親緣關(guān)系相近的菌，其 G+C mol ％含量相同或者近似，但 G+C mol ％相同或近似的細(xì)菌，其親緣關(guān)系并不一定相似，這是因?yàn)檫@一數(shù)據(jù)還不能反映出堿基對(duì)的排列序列，而且如放線菌的 DNA 的 GC mol% 在 37 ～ 51 之間，企圖在這么小的范圍內(nèi)區(qū)分放線菌的幾十個(gè)屬顯然是不現(xiàn)實(shí)的。要比較兩種細(xì)菌的 DNA 堿基對(duì)排列序列是否相同，以及相同的程度如何，就需做核酸雜交試驗(yàn)。

微生物如此，其他生物系統(tǒng)發(fā)育研究也大抵如此

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4樓2011-05-25 20:23:53

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zjx4700

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西瓜(金幣+5): Good！ 2011-05-26 22:06:09

同一物種的gc含量應(yīng)該差不多，不同物種gc含量差別很大，所以gc含量越大越不可能是一個(gè)種。

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3樓2011-05-25 16:20:12

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珠珠蝦米

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學(xué)習(xí)了，O(∩_∩)O~，最近我對(duì)這個(gè)也比較感興趣。

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5樓2011-05-26 16:47:41

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愛(ài)意濃濃

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引用回帖:

4樓: Originally posted by cdl007 at 2011-05-25 20:23:53
Goodfellow 和 O'Donnell(1993) 提出 DNA 的 G+C mol% 差異≤ 10 ％ ~12 ％及 16S rDNA 的序列同源性≥ 95 ％的種可歸為同一屬。

每一個(gè)微生物種的 DNA 中 GC mol% 的數(shù)值是恒定的，不會(huì)隨著環(huán)境條件、培養(yǎng)條件 ...

厲害！

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6樓2017-12-24 15:19:37

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