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emilyoyang木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何用xcrysden畫(huà)電荷密度圖
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相關(guān)電荷密度文件都已經(jīng)做好了，用xcrysden讀入電荷密度后，Tools->Data Grid，然后出來(lái)Isosurface/Property-plane Controls，看manual沒(méi)看太明白，想請(qǐng)教一下，如何調(diào)節(jié)相關(guān)的參數(shù)，來(lái)顯示比較美觀的電荷密度圖？ 已知道有很多選項(xiàng)可調(diào)，所以想請(qǐng)教 最基本的一些參數(shù)如何調(diào)節(jié)？該設(shè)置多少？有什么原則沒(méi)有？謝謝~~~ 另外，請(qǐng)教壇子里的大俠們 什么軟件能夠做出來(lái)漂亮的電荷密度圖？ VESTA，vaspview 已嘗試過(guò)，想問(wèn)有沒(méi)有其它的軟件？ 再次感謝~ |
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redskywei
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
liliangfang: 金幣+2, 謝謝交流 2013-09-15 09:06:18
liliangfang: 金幣+2, 謝謝交流 2013-09-15 09:06:18
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首先，你要確定你的xsf文件里只有電荷密度一種數(shù)據(jù)，而且是沒(méi)考慮自旋的，畫(huà)出來(lái)的就是總電荷密度。如果有自旋，選擇tool/data后要對(duì)你的自旋選項(xiàng)進(jìn)行設(shè)置：是要兩個(gè)相加、相減、或者只要其中一個(gè)。然后確定就出現(xiàn)了Isosurface/Property-plane Controls，這里第一個(gè)要設(shè)置的就是isovalue，如果是自旋差值的話(huà)多半還要勾選羨慕的render，正負(fù)iso面就是不同顏色了。右邊的四個(gè)選項(xiàng)你選了馬上就明白啥意思，我不一一說(shuō)明了。最右下角有個(gè)關(guān)于透明色彩的設(shè)置，里面有很多選擇方案，看你喜歡那種了。進(jìn)去試試就知道了。多數(shù)默認(rèn)就很漂亮了。 二，如果你不想要這種等值面的形式，想要面，就要把最上面的display isosurface勾掉，但是下面的值不要空著。 然后選擇你要的平面，他只有三個(gè)xyz面，你任選其一，點(diǎn)開(kāi)后有關(guān)于標(biāo)尺色系、標(biāo)尺刻度等設(shè)置，羨慕的display中最后一個(gè)therometer in toplevel不要勾選，那樣打印不出。然后點(diǎn)擊下面的箭頭移動(dòng)平面。到你想要的位置。特別注意那個(gè)format string，里面那個(gè)8.4f里的4，就是設(shè)置你的顏色標(biāo)尺的小數(shù)點(diǎn)的，根據(jù)需要調(diào)整，這個(gè)是否還有其他的東西需要高手補(bǔ)充0。No of Tics是設(shè)置顏色標(biāo)尺的顏色種類(lèi)個(gè)數(shù)的。 這些都是實(shí)時(shí)顯示的，做兩遍就都清楚了。其他的range、isoline都看英文就明白了。寫(xiě)了這么多，好累，希望你看明白了。 |
5樓2013-09-14 22:40:20
lisicheng
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
我在漂泊中
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2樓2013-01-21 14:40:26
zphu_nku
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
sunyang1988: 金幣+2, 謝謝幫助 2013-07-26 19:48:46
sunyang1988: 金幣+2, 謝謝幫助 2013-07-26 19:48:46
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首先要知道文件里面數(shù)值的含義，簡(jiǎn)單說(shuō)就是你xsf文件的grid里面包含幾個(gè)電子，把各點(diǎn)數(shù)值積分起來(lái)應(yīng)該等于這個(gè)電子數(shù)，實(shí)際上就是你要得到一個(gè)換算的系數(shù)，然后才能正確知曉給出的isosurface的具體值是多少 至于顏色按自己的喜好和易于讓人看懂為原則，因?yàn)榇蟛糠秩艘丛陔娔X上看要么在紙上看，所以配色在灰度情況下仍能反應(yīng)問(wèn)題很重要，要考慮到色盲人群。 |
3樓2013-07-23 10:36:40
4樓2013-09-14 09:33:43
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