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bjwang鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請(qǐng)問：如何l利用xcrysden畫電荷密度
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我是才學(xué)這個(gè)作圖軟件，問一個(gè)低級(jí)的問題，如何做電荷密度圖？？？我看有個(gè)網(wǎng)頁（http://web.mit.edu/xcrysden_v1.4.1/www/XCRYSDEN/doc/menus.html ）上說是從“properties”進(jìn)去，選里面的電荷密度項(xiàng)，但我安裝的程序上的按鈕“properties”是灰色的（必須安裝CRYSTAL GUI？）；看官方網(wǎng)站上介紹說是從DataGrid進(jìn)去（http://www.xcrysden.org/doc/density.html ），但我畫的好像只是結(jié)構(gòu)圖，即使設(shè)置了Isosurface參數(shù)，好像也不能和文獻(xiàn)一樣，我是重復(fù)文獻(xiàn)。 附：我畫的18個(gè)na原子團(tuán)簇的基態(tài)電荷密度圖（看著怪怪的  ），而文獻(xiàn)的圖（可能用opendx作）： 這兩者差別也太大了，哪位同學(xué)幫忙看一下問題出在哪？是我的方法的問題？還是我的數(shù)據(jù)問題？作密度圖必須安裝CRYSTAL GUI嗎？謝謝了�。�！ 附件是我的原始數(shù)據(jù)文件。 [ Last edited by bjwang on 2011-4-28 at 14:28 ] |
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quantumfang
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【答案】應(yīng)助回帖
★
bjwang(金幣+5): 謝謝兄弟熱情回帖，寫的非常詳細(xì)。其實(shí)我的數(shù)據(jù)是*.xsf文件，得到結(jié)構(gòu)圖沒問題，下面操作和你說的完全一樣，得到的就是前面的圖。 2011-04-29 10:06:03
zsl_321123(金幣+1): 感謝建議 2011-04-29 10:19:13
bjwang(金幣+5): 再次感謝！ 2011-05-07 10:54:52
bjwang(金幣+5): 謝謝兄弟熱情回帖，寫的非常詳細(xì)。其實(shí)我的數(shù)據(jù)是*.xsf文件，得到結(jié)構(gòu)圖沒問題，下面操作和你說的完全一樣，得到的就是前面的圖。 2011-04-29 10:06:03
zsl_321123(金幣+1): 感謝建議 2011-04-29 10:19:13
bjwang(金幣+5): 再次感謝！ 2011-05-07 10:54:52
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1.在計(jì)算工作目錄下用v2xsf將CHGCAR轉(zhuǎn)為CHGCAR.xsf.gz 2.在xcrysden中打開CHGCAR.xsf.gz文件，得到結(jié)構(gòu)圖 3.Tools->Data Grid-> 菜單出來后，有一個(gè)地方可以改寫數(shù)字參數(shù)，可以不改，點(diǎn)擊OK 4.新窗口Isosurface controlling window彈出后，在菜單中，有一個(gè)數(shù)字框isovalue需要填寫，填寫0.～1之間的數(shù)字，點(diǎn)擊submit看效果再次修改此數(shù)字。 可參考： http://www.xcrysden.org/doc/isocontrol.html 主要步驟是這一些，還可以進(jìn)行精細(xì)調(diào)節(jié) |
2樓2011-04-29 09:48:08
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3樓2011-04-29 10:13:53
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4樓2011-04-29 13:30:39
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5樓2011-05-08 16:48:14
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