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bjwang鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
請(qǐng)問(wèn):如何l利用xcrysden畫(huà)電荷密度
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我是才學(xué)這個(gè)作圖軟件,問(wèn)一個(gè)低級(jí)的問(wèn)題,如何做電荷密度圖???我看有個(gè)網(wǎng)頁(yè)(http://web.mit.edu/xcrysden_v1.4.1/www/XCRYSDEN/doc/menus.html )上說(shuō)是從“properties”進(jìn)去,選里面的電荷密度項(xiàng),但我安裝的程序上的按鈕“properties”是灰色的(必須安裝CRYSTAL GUI?);看官方網(wǎng)站上介紹說(shuō)是從DataGrid進(jìn)去(http://www.xcrysden.org/doc/density.html ),但我畫(huà)的好像只是結(jié)構(gòu)圖,即使設(shè)置了Isosurface參數(shù),好像也不能和文獻(xiàn)一樣,我是重復(fù)文獻(xiàn)。 附:我畫(huà)的18個(gè)na原子團(tuán)簇的基態(tài)電荷密度圖(看著怪怪的 ),而文獻(xiàn)的圖(可能用opendx作): 這兩者差別也太大了,哪位同學(xué)幫忙看一下問(wèn)題出在哪?是我的方法的問(wèn)題?還是我的數(shù)據(jù)問(wèn)題?作密度圖必須安裝CRYSTAL GUI嗎?謝謝了。! 附件是我的原始數(shù)據(jù)文件。 [ Last edited by bjwang on 2011-4-28 at 14:28 ] |
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鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
小木蟲(chóng)中醫(yī)研究院院長(zhǎng)
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1.在計(jì)算工作目錄下用v2xsf將CHGCAR轉(zhuǎn)為CHGCAR.xsf.gz 2.在xcrysden中打開(kāi)CHGCAR.xsf.gz文件,得到結(jié)構(gòu)圖 3.Tools->Data Grid-> 菜單出來(lái)后,有一個(gè)地方可以改寫(xiě)數(shù)字參數(shù),可以不改,點(diǎn)擊OK 4.新窗口Isosurface controlling window彈出后,在菜單中,有一個(gè)數(shù)字框isovalue需要填寫(xiě),填寫(xiě)0.~1之間的數(shù)字,點(diǎn)擊submit看效果再次修改此數(shù)字。 可參考: http://www.xcrysden.org/doc/isocontrol.html 主要步驟是這一些,還可以進(jìn)行精細(xì)調(diào)節(jié) |
至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
小木蟲(chóng)中醫(yī)研究院院長(zhǎng)
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