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吳美儒新蟲(chóng) (小有名氣)
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一段序列怎么查找其外顯子和內(nèi)含子呀？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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NCBI里面有基因全序列的，但是看外顯子或者內(nèi)含子要注意是哪個(gè)轉(zhuǎn)錄本，轉(zhuǎn)錄本不同外顯子也不一樣，我一般用ensembl.org，選擇物種、轉(zhuǎn)錄本后左側(cè)列表會(huì)顯示exon，點(diǎn)進(jìn)去就可以看到很詳細(xì)的外顯子序列，內(nèi)含子只寫(xiě)出開(kāi)頭和結(jié)尾的幾十bp，可對(duì)照NCBI數(shù)據(jù)找到。另外，不同數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)會(huì)有偏差，但不會(huì)影響太大，自己取舍。再另，CDS一定是外顯子組成的，但CDS是coding sequence，cDNA序列時(shí)才用，而我們用到的外顯子組成的序列是mRNA。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
吳美儒
6樓2017-02-24 11:53:57
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2樓2017-02-23 14:44:28
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3樓2017-02-23 15:11:45
葉小宥
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4樓2017-02-24 11:19:24
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