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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 生物信息 » 序列
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吳美儒新蟲 (小有名氣)
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序列 已有3人參與
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一段序列怎么查找其外顯子和內(nèi)含子呀？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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jurkat.1640
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5樓2017-02-24 11:24:36
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NCBI里面有基因全序列的，但是看外顯子或者內(nèi)含子要注意是哪個轉(zhuǎn)錄本，轉(zhuǎn)錄本不同外顯子也不一樣，我一般用ensembl.org，選擇物種、轉(zhuǎn)錄本后左側(cè)列表會顯示exon，點進去就可以看到很詳細的外顯子序列，內(nèi)含子只寫出開頭和結(jié)尾的幾十bp，可對照NCBI數(shù)據(jù)找到。另外，不同數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)會有偏差，但不會影響太大，自己取舍。再另，CDS一定是外顯子組成的，但CDS是coding sequence，cDNA序列時才用，而我們用到的外顯子組成的序列是mRNA。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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吳美儒6樓2017-02-24 11:53:57
吳美儒
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7樓2017-02-24 13:38:13
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