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Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實(shí)現(xiàn)單機(jī)并行計(jì)算20150602（原創(chuàng)）
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見附件。 自己總結(jié)的Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實(shí)現(xiàn)單機(jī)并行計(jì)算的方法。 對(duì)老鳥沒啥用。對(duì)新手還有一定借鑒意義的。 有不合適的地方歡迎指正！��！我把文字貼出來，要看圖片的直接下載附件！ Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實(shí)現(xiàn)單機(jī)并行計(jì)算20150602（龍門鏢局） 讓學(xué)生搞了半年Lammps，居然說win7 64位不能安裝�，F(xiàn)在有時(shí)間，索性自己來搞定。經(jīng)過一天的努力，終于實(shí)現(xiàn)win7 64位下使用Lammps，并實(shí)現(xiàn)MPICH單機(jī)下的并行計(jì)算。注意：不使用任何虛擬機(jī)。 一、 Lammpus軟件下載和安裝 進(jìn)入Lammpus官方網(wǎng)站下載：http://lammps.sandia.gov/download.html 直接點(diǎn)擊倒數(shù)第二個(gè)鏈接“windows installer package”下載安裝包。 點(diǎn)擊頁(yè)面下方，“Latest version for 64-bit Windows”下載最新的版本。下載后大約48.6M，點(diǎn)擊安裝包，安裝。 二、 Lammpus軟件測(cè)試 安裝完后到安裝目錄下，能找到一個(gè)bin文件夾。Lammps的可執(zhí)行文件就在這個(gè)文件夾下。 對(duì)于初學(xué)者，我們一般只調(diào)用兩個(gè)exe文件，一個(gè)是lmp_serial.exe，這個(gè)文件適用于非并行計(jì)算的。另一個(gè)是lmp_mpi.exe，這個(gè)在MPICH配合下可以實(shí)現(xiàn)單機(jī)多線程計(jì)算和多機(jī)分布式計(jì)算。 先用lmp_serial.exe來測(cè)試安裝的程序是否可用。我用example/crack/in.crack文件來測(cè)試。lammps的輸入文件都命名為in.xxx。 打開windows命令窗口，可以在windos開始菜單中的運(yùn)行窗口輸入cmd打開。 然后在cmd窗口用cd命令（cd命令是dos命令）進(jìn)入lammps的bin文件夾。在cmd窗口中輸入lmp_serial –in in.crack回車，開始計(jì)算。 計(jì)算完的窗口如下圖所示。 說明安裝是沒問題的。計(jì)算時(shí)間是15s，用了4個(gè)線程。不知道這里4個(gè)線程指的啥。我是I5的cpu，計(jì)算時(shí)看cpu使用不到50%。根據(jù)http://rpm.lammps.org/windows.html的提示可以在命令行通過set OMP_NUM_THREADS=n（這里n表示線程數(shù)）來設(shè)置多線程運(yùn)算。但是經(jīng)過試驗(yàn)，不論n=1，4，還是8，計(jì)算時(shí)間都等于15s。 三、 下載MPICH MPICH軟件可以到網(wǎng)關(guān)下載：http://www.mpich.org/。但是要注意，MPICH其實(shí)即包含了用于并行計(jì)算編程的sdk資源，也包含了可行文件。我們這里只用到MPICH的可執(zhí)行文件。打開http://www.mpich.org/后最新版本的都是用于編程的sdk資源。這目前對(duì)我們來說沒有用，我們要找可執(zhí)行文件。 因此我們?cè)陧?yè)面中找“Older releases are available here”.點(diǎn)擊這個(gè)here下載之前的版本。點(diǎn)擊here后進(jìn)入http://www.mpich.org/static/downloads/頁(yè)面。 截至到發(fā)稿時(shí)間，只有1.4版本的提供windows 64位的MPICH可執(zhí)行文件。下載mpich2-1.4-win-x86-64.msi并安裝。安裝成功后進(jìn)入下一步。 四、 配置MPICH并運(yùn)行 安裝成功后，在MPICH2\bin文件夾下可以找到smpd.exe和mpiexec.exe連個(gè)文件。為了方便后面使用，把這兩個(gè)文件拷貝到lammps的bin文件夾下。 先右鍵點(diǎn)擊smpd.exe，點(diǎn)擊屬性，設(shè)置為管理員權(quán)限。然后在cmd窗口中輸入smpd –install。安裝MPICH2服務(wù)。如果沒有安裝成功，后面運(yùn)行mpiexec的時(shí)候會(huì)出現(xiàn)“由于服務(wù)器的積極拒絕”之類的錯(cuò)誤。有的帖子說要運(yùn)行smpd -install -phrase beHappy來注冊(cè)，不知道和smpd –install命令是否等價(jià)。總之兩個(gè)命令我都運(yùn)行了。最關(guān)鍵的步驟就是要把smpd的屬性設(shè)定為管理員權(quán)限。 然后在win7控制面板里創(chuàng)建一個(gè)MPI的管理員帳戶，密碼也設(shè)定為MPI。 運(yùn)行mpiexec.exe –register注冊(cè)賬戶。這里的賬戶名稱和密碼就是剛才創(chuàng)建的，都是MPI。 然后在cmd窗口輸入mpiexec -n 2 lmp_mpi -in in.crack命令。一會(huì)功夫就計(jì)算出來了，系統(tǒng)提示耗時(shí)10s。證明并行起了成效。 |
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2015-06-03 07:14:40, 477.97 K
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