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Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實現(xiàn)單機(jī)并行計算20150602（原創(chuàng)）
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見附件。 自己總結(jié)的Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實現(xiàn)單機(jī)并行計算的方法。 對老鳥沒啥用。對新手還有一定借鑒意義的。 有不合適的地方歡迎指正�。�！我把文字貼出來，要看圖片的直接下載附件！ Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實現(xiàn)單機(jī)并行計算20150602（龍門鏢局） 讓學(xué)生搞了半年Lammps，居然說win7 64位不能安裝。現(xiàn)在有時間，索性自己來搞定。經(jīng)過一天的努力，終于實現(xiàn)win7 64位下使用Lammps，并實現(xiàn)MPICH單機(jī)下的并行計算。注意：不使用任何虛擬機(jī)。 一、 Lammpus軟件下載和安裝 進(jìn)入Lammpus官方網(wǎng)站下載：http://lammps.sandia.gov/download.html 直接點擊倒數(shù)第二個鏈接“windows installer package”下載安裝包。 點擊頁面下方，“Latest version for 64-bit Windows”下載最新的版本。下載后大約48.6M，點擊安裝包，安裝。 二、 Lammpus軟件測試 安裝完后到安裝目錄下，能找到一個bin文件夾。Lammps的可執(zhí)行文件就在這個文件夾下。 對于初學(xué)者，我們一般只調(diào)用兩個exe文件，一個是lmp_serial.exe，這個文件適用于非并行計算的。另一個是lmp_mpi.exe，這個在MPICH配合下可以實現(xiàn)單機(jī)多線程計算和多機(jī)分布式計算。 先用lmp_serial.exe來測試安裝的程序是否可用。我用example/crack/in.crack文件來測試。lammps的輸入文件都命名為in.xxx。 打開windows命令窗口，可以在windos開始菜單中的運行窗口輸入cmd打開。 然后在cmd窗口用cd命令（cd命令是dos命令）進(jìn)入lammps的bin文件夾。在cmd窗口中輸入lmp_serial –in in.crack回車，開始計算。 計算完的窗口如下圖所示。 說明安裝是沒問題的。計算時間是15s，用了4個線程。不知道這里4個線程指的啥。我是I5的cpu，計算時看cpu使用不到50%。根據(jù)http://rpm.lammps.org/windows.html的提示可以在命令行通過set OMP_NUM_THREADS=n（這里n表示線程數(shù)）來設(shè)置多線程運算。但是經(jīng)過試驗，不論n=1，4，還是8，計算時間都等于15s。 三、 下載MPICH MPICH軟件可以到網(wǎng)關(guān)下載：http://www.mpich.org/。但是要注意，MPICH其實即包含了用于并行計算編程的sdk資源，也包含了可行文件。我們這里只用到MPICH的可執(zhí)行文件。打開http://www.mpich.org/后最新版本的都是用于編程的sdk資源。這目前對我們來說沒有用，我們要找可執(zhí)行文件。 因此我們在頁面中找“Older releases are available here”.點擊這個here下載之前的版本。點擊here后進(jìn)入http://www.mpich.org/static/downloads/頁面。 截至到發(fā)稿時間，只有1.4版本的提供windows 64位的MPICH可執(zhí)行文件。下載mpich2-1.4-win-x86-64.msi并安裝。安裝成功后進(jìn)入下一步。 四、 配置MPICH并運行 安裝成功后，在MPICH2\bin文件夾下可以找到smpd.exe和mpiexec.exe連個文件。為了方便后面使用，把這兩個文件拷貝到lammps的bin文件夾下。 先右鍵點擊smpd.exe，點擊屬性，設(shè)置為管理員權(quán)限。然后在cmd窗口中輸入smpd –install。安裝MPICH2服務(wù)。如果沒有安裝成功，后面運行mpiexec的時候會出現(xiàn)“由于服務(wù)器的積極拒絕”之類的錯誤。有的帖子說要運行smpd -install -phrase beHappy來注冊，不知道和smpd –install命令是否等價。總之兩個命令我都運行了。最關(guān)鍵的步驟就是要把smpd的屬性設(shè)定為管理員權(quán)限。 然后在win7控制面板里創(chuàng)建一個MPI的管理員帳戶，密碼也設(shè)定為MPI。 運行mpiexec.exe –register注冊賬戶。這里的賬戶名稱和密碼就是剛才創(chuàng)建的，都是MPI。 然后在cmd窗口輸入mpiexec -n 2 lmp_mpi -in in.crack命令。一會功夫就計算出來了，系統(tǒng)提示耗時10s。證明并行起了成效。 |
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2015-06-03 07:14:40, 477.97 K
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39樓2015-07-20 15:53:20
41樓2015-08-03 16:41:44
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需要這么麻煩嗎 我是直接安裝完mpich后把mpiexec拷貝到lammps下的bin里就可以用了 只是他提示openmpi environment variable is not set之類的 但是不影響并行計算 而且不需要設(shè)置什么mpi管理員密碼啥的 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
49樓2015-10-24 23:48:26
簡單回復(fù)
2015-06-03 23:19
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yujingui7樓
2015-06-04 12:58
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2015-06-05 20:25
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